Zabiák, A., Kovács, C., Takács, F., Pál, K., Peles, F., Fekete, E., Karaffa, L., Mihály, K., Flipphi, M., Karaffa, E.: Diaporthe and Diplodia species associated with walnut (Juglans regia L.) in Hungarian orchards.
Horticulturae. 2023 (9), 1-15, 2023.

Csótó, A., Kovács, C., Pál, K., Nagy, A., Peles, F., Fekete, E., Karaffa, L., Kubicek, C., Karaffa, E.: The Biocontrol Potential of Endophytic Trichoderma Fungi Isolated from Hungarian Grapevines, Part II, Grapevine Stimulation.
Pathogens. 12 (1), 1-14, 2023.

Csótó, A., Baranyi, D., Szakadát, G., Karaffa, E.: A fajták és egyes környezeti tényezők hatása a szőlő fertőző tőkepusztulás előfordulására: megfigyelések az Egri Borvidék epidemiológiai felmérése alapján.
Növényvédelem. 83 (7), 297-305, 2022.

Csótó, A., Baranyi, D., Szakadát, G., Karaffa, E.: A szőlő fertőző tőkepusztulás epidemiológiai felmérésének tanulságai az egri borvidéken.
In: 68. Növényvédelmi Tudományos Napok 2022. Szerk.: Haltrich Attila, Varga Ákos, Magyar Növényvédelmi Társaság, Budapest, 39, 2022.

Fekete, E., Bíró, V., Márton, A., Bakondi-Kovács, I., Németh, Z., Karaffa, E., Kovács, B., Fábián, I., Kubicek, C., Tsang, A., Karaffa, L.: Bioreactor as the root cause of the "manganese effect" during Aspergillus niger citric acid fermentations.
Front. Bioeng. Biotechnol. "Accepted by Publisher" (-), 01-12, 2022.

Csótó, A., Hegedűs, L., Pájtliné Tánczos, E., Hegymegi, F., Pál, K., Szakadát, G., Karaffa, E.: Egy dél-balatoni szőlőültetvény hosszú időtávú felmérésének és felszámolásának tanulságai a fertőző tőkeelhalás tekintetében.
In: XXIV. Tavaszi Szél Konferencia 2021 : Absztraktkötet. Szerk.: Molnár Dániel, Molnár Dóra, Doktoranduszok Országos Szövetsége, Budapest, 75, 2021. ISBN: 9786155586996

Kovács, C., Csótó, A., Pál, K., Nagy, A., Fekete, E., Karaffa, L., Kubicek, C., Karaffa, E.: Endophytic Trichoderma spp. from Hungarian grapevines with biocontrol potential.
In: 16th Congress of the Mediterranean Phytopathological Union : Book of abstracts, [s.n.], [s.l.], 1, 2022.

Csótó, A., Baranyi, D., Szakadát, G., Karaffa, E.: Epidemiological survey of grapevine trunk diseases in the Eger Wine Region..
In: 12th International Workshop on Grapevine Trunk Diseases / Ales Eichmeier, [s.n.], [s.l.], 120, 2022.

Csótó, A., File, M., Piti, A., Ellmann, B., Pál, K., Szakadát, G., Karaffa, E.: Potential GTDs antagonist microfungi isolated from grapevines.
In: 12th International Workshop on Grapevine Trunk Diseases / Ales Eichmeier, [s.n.], [s.l.], 121, 2022.

Csótó, A., File, M., Piti, A., Ellmann, B., Pál, K., Szakadát, G., Karaffa, E.: Szőlőből izolált potenciális antagonista és biostimulátor hatású mikrogombák minősítési vizsgálatai.
In: 68. Növényvédelmi Tudományos Napok 2022. Szerk.: Haltrich Attila, Varga Ákos, Magyar Növényvédelmi Társaság, Budapest, 37, 2022.

Csótó, A., Balling, P., Rakonczás, N., Kovács, C., Nagy, A., Karaffa, E.: The effect of extreme weather conditions on the incidence and spreading of grapevine trunk diseases.
In: 16th Congress of the Mediterranean Phytopathological Union : Book of abstracts, [s.n.], [s.l.], 1, 2022.

Mihály, K., Szőllősi, E., Homoki, J., Nagy, A., Takács, F., Karaffa, E.: The possibilities for Hungarian sour cherries for storage and elongation of fresh consumption.
In: Program and Book of Abstracts, Innovation and advanced technologies for managing postharvest pathogens / Nikolaos Tzortzakis, Chris Watkins, Haissam Jijakli et al, International Society for Plant Pathology, Limassol, Cyprus, 145, 2022.

Csótó, A., Kovács, C., Karaffa, E.: Trichoderma készítmények a növényápolásban.
Agroforum. 33 (9), 52-54, 2022.

Fekete, E., Pénzes, F., Ág, N., Ág-Rácz, V., Karaffa, E., Scazzocchio, C., Flipphi, M., Karaffa, L.: Unique and Repeated Stwintrons (Spliceosomal Twin Introns) in the Hypoxylaceae.
J. Fungi. 8 (4), 1-23, 2022.

Piti, A., Szakál, I., Karaffa, E., Csótó, A.: Antagonista mikrogomba-törzsek hatékonyság vizsgálata növénypatogénekkel szemben.
In: 25-26. Tiszántúli Növényvédelmi Fórum 9th International Plant Protection Symposium at University of Debrecen Összefoglalók - Abstracts. Szerk.: Kövics György, Tarcali Gábor, DE MÉK, Debrecen, 50-51, 2021.

Karaffa, E., Csótó, A.: A szőlő fertőző tőkeelhalásának (GTD) kórokozói, és védekezési lehetőségek.

Marchand, P., Davillerd, Y., Riccioni, L., Sanzani, S., Horn, N., Matyjaszczyk, E., Golding, J., Roberto, S., Mattiuz, B., Xu, D., Guo, X., Tzortzakis, N., Ruiz, Y., Pavela, R., Karaffa, E., Khamis, Y., Hosseinifarahi, M., Ippolito, A., Di Francesco, A., Germinara, G., Toffolatti, S., Sannino, F., Chaves-Lopez, C., Mezzalama, M., Mori, N., Bautista-Banos, S., Martinez, P., Kowalska, J., Gonzalez-Candelas, L., Garde-Cerdán, T., Allagui, M., Teksur, P., Moumni, M., Giovani, B., Romanazzi, G.: BasicS, an Euphresco International Network on Renewable Natural Substances for Durable Crop Protection Products.
Chronicle of Bioresource Management 5 (3), 77-80, 2021.

Csótó, A., Hegymegi, F., Pál, K., Kovács, C., Szakadát, G., Karaffa, E.: Biológiai ágensek a szőlő fás betegségei elleni védekezésben.
In: XIV. Szent-Györgyi Konferencia Kiadványa. Szerk.: Szathmári Balázs, BME Szent-Györgyi A. Szakkollégium, Budapest, 78, 2021.

Karaffa, E., Kolláth, I., Fekete, E., Bíró, V., Flipphi, M., Kovács, B., Kubicek, C., Karaffa, L.: Carbon-source dependent interplay of copper and manganese ions modulates the morphology and itaconic acid production in Aspergillus terreus.
Front. Microbiol. 12 1-14, 2021.

Mihály, K., Kovács, C., Nagy, A., Takács, F., Karaffa, E.: Comparison of the shelf life and surface mold population of Hungarian Prunus cerasus cultivars following different pre- and posthavest treatments.
Acta Hortic. 1325 347-356, 2021.

Kovács, C., Csótó, A., Karaffa, E.: Hazai kutatócsoport egy euphresco basics projektben.
Növényvédelem. 82 (6), 267-268, 2021.

File, M., Szakadát, G., Karaffa, E., Csótó, A.: Potenciális antagonista és biostimulátor hatású gombatörzsek tenyészthetőségi és összeférhetőségi vizsgálatai.
In: 25-26. Tiszántúli Növényvédelmi Fórum 9th International Plant Protection Symposium at University of Debrecen Összefoglalók - Abstracts. Szerk.: Kövics György, Tarcali Gábor, DE MÉK, Debrecen, 60-61, 2021.

Karaffa, E.: Pre-postharvest Application of Chitosan Against Postharvest Decay of Sour Cherry.

Kovács, C., Csótó, A., Pál, K., Nagy, A., Fekete, E., Karaffa, L., Kubicek, C., Karaffa, E.: The Biocontrol Potential of Endophytic Trichoderma Fungi Isolated from Hungarian Grapevines. Part I. Isolation, Identification and In Vitro Studies.
Pathogens. 10 (12), 1-19, 2021.

Csótó, A., Hegymegi, F., Pál, K., Szakadát, G., Karaffa, E.: Törzsgyűjtemény-fejlesztés Magyarországon előforduló, szőlőből izolált endofiton gombafajokból.
In: 67. Növényvédelmi Tudományos Napok 2021. Szerk.: Haltrich Attila, Varga Ákos, Magyar Növényvédelmi Társaság, Budapest, 28, 2021.

Csótó, A., Balling, P., Rakonczás, N., Kovács, C., Nagy, A., Karaffa, E.: A környezeti tényezők hatása a szőlő fertőző tőkeelhalás betegség előfordulására és ültetvénybeni terjedésére tartamkísérletekben.
In: 66. Növényvédelmi Tudományos Napok 2020. Szerk.: Haltrich Attila, Varga Ákos, Magyar Növényvédelmi Társaság, Budapest, 46, 2020.

Takács, F., Mihály, K., Kovács, C., Karaffa, E.: Comparison of the shelf life and surface mold population of Hungarian Prunus cerasus cultivars following different pre- and postharvest treatments.
In: Vth International Symposium on Postharvest Pathology : Book of abstracts, Université de Liège, Liège, 167, 2020.

Mihály, K., Karaffa, E., Kovács, C., Takács, F.: Effect of different storage methods for the self-life and the fungal populations of the Hungarian sour cherry cultivars.
Acta Hortic. 59 427-432, 2020.

Mihály, K., Takács, F., Nagy, A., Karaffa, E.: Kitozán alapú kezelés hatása a maggy polcállóságára.
In: 66. Növényvédelmi Tudományos Napok 2020. Szerk.: Haltrich Attila, Varga Ákos, Magyar Növényvédelmi Társaság, Budapest, 94, 2020.

Csótó, A., Németh, C., Nagy, Z., Májer, J., Karaffa, E.: Szőlő fertőző tőkebetegségének megjelenési aránya, és a kialakításában szerepet játszó kórokozó gombák előfordulása a Badacsonyi borvidéken.
In: 66. Növényvédelmi Tudományos Napok 2020. Szerk.: Haltrich Attila, Varga Ákos, Magyar Növényvédelmi Társaság, Budapest, 88, 2020.

Fejes, B., Ouedraogo, J., Fekete, E., Karaffa, E., Flipphi, M., Soós, Á., Molnár, Á., Kovács, B., Kubicek, C., Tsang, A., Karaffa, L.: The effects of external Mn2+ concentration on hyphal morphology and citric acid production are mediated primarily by the NRAMP-family transporter DmtA in Aspergillus niger.
Microb Cell Fact. 19 (1), 1-11, 2020.

Csótó, A., Balling, P., Nagy, A., Karaffa, E.: The role of cultivar susceptibility and vineyard age in GTD: examples from the Carpathian Basin.
Agrártud. közl. 2 57-63, 2020.

Alexa, L., Mihály, K., Kerekes, G., Nagy, T., Takács, F., Karaffa, E.: Antioxidáns hatású vegyületek mennyiségének változása tárolás és preharveszt kezelések függvényében három magyarországi meggyfajta eredményei alapján.
In: Magyar Táplálkozástudományi Társaság XLIV. Vándorgyűlése programja és az előadások összefoglalói. Szerk.: Antal Emese, Biró Lajos, Gelencsér Éva, Lugasi Andrea, Rurik Imre, Magyar Táplálkozástudományi Társaság, Budapest, 11, 2019. ISBN: 9786155606090

Zabiák, A., Takács, F., Karaffa, E.: Fungal population of rotted walnuts and their antifungal sensitivity.
Acta Microbiol. Immunol. Hung. Suppl. 209, 2019.

Kolláth, I., Molnár, Á., Soós, Á., Fekete, E., Karaffa, E., Kovács, B., Kubicek, C., Karaffa, L.: Manganese Deficiency Is Required for High Itaconic Acid Production From D-Xylose in Aspergillus terreus.
Front. Microbiol. 10 1-10, 2019.

Mihály, K., Kovács, C., Takács, F., Karaffa, E.: Pre- and postharvest technologies to extend the shelf life of Prunus cerasus.
Agrártud. Közl. 1 85-89, 2019.

Mihály, K., Kovács, C., Takács, F., Karaffa, E.: Szüret előtti növényvédelmi kezelések hatása a meggy romlást okozó gombapopuláció összetételére és polcállóságára.
Növényvédelem. 55 (1), 18-28, 2019.

Mihály, K., Takács, F., Karaffa, E.: The effectiviness of different storage methods for the shelf-life and the fungal populations of the Hungarian tart cherry varieties.
In: XXV. National Congress Italian Phytopathological Society (SIPaV) : Book of abstracts, Universita degli Studi di Milano, Milan, 105, 2019.

Zabiák, A., Takács, F., Karaffa, E.: Walnut blight causing by endophytic fungi during differ- ent phenological phases of the host.
J. Plant Pathol. 101 847, 2019.

Kovács, C., Balling, P., Bihari, Z., Nagy, A., Karaffa, E.: Abiotic factors effecting grapevine trunk disease incidence between vineyards in the Tokaj wine region, Hungary.
J. Plant Pathol. 100 (3), 631, 2018.

Tóth, A., Kovács, C., Karaffa, E.: Characterization of endophytic fungi isolated from grapevines by matrix-assisted laser de- sorption time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS).
J. Plant Pathol. 100 (3), 652, 2018.

Karaffa, E., Mihály, K., Kovács, C., Takács, F.: Developing pre- and postharvest technology for the fresh fruit storage of tart cherry (Prunus cerasus l.).
In: FSD 2018 3rd Food Structure & Design Conference : Abstract Book. Ed.: Zoltán Győri, Debreceni Egyetem, Debrecen, 11, 2018. ISBN: 9789634900245

Guarnaccia, V., Groenewald, J., Woodhall, J., Armengol, J., Cinelli, T., Eichmeier, A., Ezra, D., Fontaine, F., Gramaje, D., Gutierrez-Aguirregabiria, A., Kaliterna, J., Kiss, L., Larignon, P., Luque, J., Mugnai, L., Naor, V., Raposo, R., Karaffa, E., Váczy, K., Crous, P.: Diaporthe diversity and pathogenicity revealed from a broad survey of grapevine diseases in Europe.
Persoonia. 40 (1), 135-153, 2018.

Kolláth, I., Fekete, E., Karaffa, E., Soós, Á., Kovács, B., Karaffa, L.: Effect of copper (Il) ions on itaconic acid prodoction by Aspergilius terreus.
In: VII. Interdiszciplináris Doktorandusz Konferencia 2018 absztraktkötet. Szerk.: Bódog Ferenc, Pécsi Tudományegyetem Doktorandusz Önkormányzat, Pécs, 74, 2018. ISBN: 9789634292104

Molnár, Á., Németh, Z., Kolláth, I., Fekete, E., Flipphi, M., Ág, N., Soós, Á., Kovács, B., Karaffa, E., Kubicek, C., Karaffa, L.: High oxygen tension increases itaconic acid accumulation, glucose consumption, and the expression and activity of alternative oxidase in Aspergillus terreus.
Appl. Microbiol. Biotechnol. 102 (20), 8799-8808, 2018.

Kovács, C., Takács, F., Tóth, A., Karaffa, E.: Identification of pathogenic fungi in rotten wal- nut fruits from different plantations in Hungary.
J. Plant Pathol. 100 (3), 631, 2018.

Mihály, K., Kovács, C., Takács, F., Karaffa, E.: Preharvest treatments modified surface molds population and the shelf life of tart cherry (Prunus cerasus L.).
In: XXIV. National Congress Italian Phytopathological Society (SIPaV): Book of abstracts. Ed.: by Gianfranco Romanazzi, Lucia Landi, Sergio Murolo, Erica Feliziani, Valeria Mancini, Luisa Rubino, Università Politecnica Delle Marche, Ancona, 134, 2018.

Mihály, K., Kovács, C., Takács, F., Karaffa, E.: Preharvest treatments modified surface molds population and the shelf life of tart cherry (Prunus cerasus L.).
J. Plant Pathol. 100 (3), 637, 2018.

Mihály, K., Mohos, C., Kovács, C., Takács, F., Karaffa, E.: Preharveszt kezelések hatása a meggy polcállóságára és a felületén megtalálható penész telepképző egység mennyiségére.
In: 64. Növényvédelmi Tudományos Napok: Absztrakt és poszter kötet. Szerk.: Haltrich Attila, Varga Ákos, Magyar Növényvédelmi Társaság, Budapest, 63, 2018.

Mihály, K., Kovács, C., Takács, F., Karaffa, E.: The gamma radiation modified rottening fungal poulation and shelf-life of the tart cherry (Prunus cerasus).
In: FSD 2018 3rd Food Structure & Design Conference : Abstract Book. Ed.: Zoltán Győri, Debreceni Egyetem, Debrecen, 40-41, 2018. ISBN: 9789634900245

Mihály, K., Kovács, C., Bujáki, B., Takács, F., Karaffa, E.: A sugárkezelés és a módosított légterű tárolás hatása a frissfogyasztású meggy polcállóságára.
In: LIX. Georgikon Napok : Kivonat-kötet : A múltmér földkövei és a jövő kihívásai: 220 éves a Georgikon. Szerk.: Nagy Zita Barbara, Pannon Egyetem Georgikon Kar, Keszthely, 357-368, 2017. ISBN: 9789639639898

Mihály, K., Kovács, C., Bujáki, B., Takács, F., Karaffa, E.: A sugárkezelés és a módosított légterű tárolás hatása a frissfogyasztású meggy polcállóságára.
In: LIX. Georgikon Napok: Kivonatkötet: A múlt mérföldkövei és a jövő kihívásai: 220 éves a Georgikon. Szerk.: Nagy Zita Barbara, Pannon Egyetem Georgikon Kar, Keszthely, 125, 2017. ISBN: 9789639639881

Mihály, K., Kovács, C., Takács, F., Karaffa, E.: Combined effect of MAP and gamma radiation for shelf life of tart cherry (Prunus Cerasus L.).
In: Scientific researches in food production, FBFS, SUA in Nitra - Proceedings of abstracts. Ed.: Miroslava Kačániová, Slovak University of Agriculture in Nitra, Nitra, 10-11, 2017. ISBN: 9788055217369

De Vries, R., Riley, R., Wiebenga, A., Aguilar-Osorio, G., Amillis, S., Akemi Uchima, C., Anderluh, G., Asadollahi, M., Askin, M., Barry, K., Battaglia, E., Bayram, Ö., Benocci, T., Braus-Stromeyer, S., Caldana, C., Cánovas, D., Cerqueira, G., Chen, F., Chen, W., Choi, C., Clum, A., Corrêa dos, S., Lima Damásio, A., Diallinas, G., Emri, T., Fekete, E., Flipphi, M., Freyberg, S., Gallo,, A., Gournas, C., Habgood, R., Hainaut, M., Harispe, M., Henrissat, B., Hildén, K., Hope, R., Hossain, A., Karabika, E., Karaffa, L., Karányi, Z., Kraševec, N., Kuo, A., Kusch, H., LaButti, K., Lagendijk, E., Lapidus, A., Levasseur, A., Lindquist, E., Lipzen, A., Logrieco, A., MacCabe, A., Mäkelä, M., Malavazi, I., Melin, P., Meyer, V., Mielnichuk, N., Miskei, M., Molnár, Á., Mulé, G., Ngan, C., Orejas, M., Orosz, E., Ouedraogo, J., Overkamp, K., Park, H., Perrone, G., Piumi, F., Punt, P., Ram, A., Ramón, A., Rauscher, S., Record, E., Riaño-Pachón, D., Robert, V., Röhrig, J., Ruller, R., Salamov, A., Salih, N., Samson, R., Karaffa, E., Sanguinetti, M., Schütze, T., Sepčić, K., Shelest, E., Sherlock, G., Sophianopoulou, V., Squina, F., Sun, H., Susca, A., Todd, R., Tsang, A., Unkles, S., Wiele, N., Rossen-Uffink, D., Velasco de, C., Vesth, T., Visser, J., Yu, J., Zhou, M., Andersen, M., Archer, D., Baker, S., Benoit, I., Brakhage, A., Braus, G., Fischer, R., Frisvad, J., Goldman, G., Houbraken, J., Oakley, B., Pócsi, I., Scazzocchio, C., Seiboth, B., Kuyk, P., Wortman, J., Dyer, P., Grigoriev, I.: Comparative genomics reveals high biological diversity and specific adaptations in the industrially and medically important fungal genus Aspergillus.
Genome Biol. 18 (28), 1-45, 2017.

Kulcsár, L., Flipphi, M., Jónás, Á., Karaffa, E., Fekete, E., Karaffa, L.: Identification of a mutarotase gene involved in D-galactose utilization in Aspergillus nidulans.
FEMS Microbiol. Lett. 364 1-7, 2017.

Kovács, C., Balling, P., Bihari, Z., Nagy, A., Karaffa, E.: Incidence of grapevine trunk diseases is influenced by soil, topology and vineyard age, but not by Diplodia seriata infection rate in the Tokaj Wine Region, Hungary.
Phytoparasitica. 45 (1), 21-32, 2017.

Mihály, K., Kovács, C., Bujáki, B., Takács, F., Karaffa, E.: Preharveszt kezelések és módosított légterű tárolás hatása a meggy romlását okozó gombapopuláció összetételére.
In: 63. Növényvédelmi Tudományos Napok: Absztrakt és poszter kötet. Szerk.: Horváth József, Haltrich Attila, Molnár János, Magyar Növényvédelmi Társaság, Budapest, 53, 2017.

Kolláth, I., Molnár, Á., Fekete, E., Karaffa, E., Soós, Á., Kovács, B., Kubicek, C., Karaffa, L.: Production of itaconic acid from D-xylose by Aspergillus terreus.
In: Abstracts of the 5th Central European Forum for Microbiology. Ed.: K. Márialigeti, O. Dobay, Akadémiai Kiadó, Budapest, 136, 2017, (Acta Microbiologica et Immunologica Hungarica, ISSN 1217-8950 ; 64. (Suppl))

Kolláth, I., Molnár, Á., Fekete, E., Karaffa, E., Soós, Á., Kovács, B., Kubicek, C., Karaffa, L.: Production of itaconic acid from D-xylose by Aspergillus terreus.
In: 2nd Symposium on Plant Biomass Conversation by Fungi, Westerdijk Fungal Biodiversity Institute, Utrecht, Hollandia, 25, 2017.

Kovács, C., Sipos, S., Takács, F., Karaffa, E.: A meggy tárolását javító pre-, és posztharveszt technológiák vizsgálata.
In: 62. Növényvédelmi Tudományos Napok. Szerk.: Horváth József, Haltrich Attila, Molnár János, Magyar Növényvédelmi Társaság, Budapest, 88, 2016.

Kovács, C., Csótó, A., Rakonczás, N., Karaffa, E.: A szőlő tőkebeteségeinek vizsgálata a Debreceni Egyetem Pallagi Kertészeti Kísérleti Telepének fajtagyűjteményében.
In: 62. Növényvédelmi Tudományos Napok. Szerk.: Horváth József, Haltrich Attila, Molnár János, Magyar Növényvédelmi Társaság, Budapest, 87, 2016

Kovács, C., Balling, P., Bihari, Z., Karaffa, E.: A szőlő tőkeelhalásában szerepet játszó patogén és endofita gombák jelenléte 2013-2015 között a Tokaji Borvidék szőlőiben.
In: 62. Növényvédelmi Tudományos Napok. Szerk.: Horváth József, Haltrich Attila, Molnár János, Magyar Növényvédelmi Társaság, Budapest, 57, 2016.

Kovács, C., Sipos, S., Takács, F., Karaffa, E.: Changes of quality parameters and decaying fungal community following modified atmosphere packaging of Prunus cerasus fruits.
In: Meeting of Young Researchers from V4 Countries Abstract book. Ed.: Monika Wesołowska, University of Rzeszow, Rzeszow, 44, 2016.

Kovács, C., Karaffa, E.: Grapevine Trunk Diseases Research in Hungary during 2013-2015.
In: Meeting of Young Researchers from V4 Countries Abstract book. Ed.: Monika Wesołowska, University of Rzeszow, Rzeszow, 43, 2016.

Takács, F., Karaffa, E., Nagy, T.: Gyümölcstárolás.
In: Meggy : A jövedelmező intenzív termesztés alapjaival. Szerk.: Nyéki József, Szabó Tibor, Soltész Miklós, ÉKASZ Szakmaközi Szervezet és Terméktanács, Újfehértó, 312-318, 2016. ISBN: 9789631265231

Papp, B., Török, T., Karaffa, E., Fekete, E., Flipphi, M., Karaffa, L.: High cell density cultivation of the chemolithoautotrophic bacterium Nitrosomonas europaea.
Folia Microbiol. 99 (19), 7937-7944, 2016.

Belovecz, K., Karaffa, E., Kovács, C.: Identification of pathogenic fungi from rotten walnuts (Juglans regia).
In: The International Conference for Students - Student in Bucovina Abstract book, Stefan cel Mare University of Suceava, Romania, Bucovina, 32, 2016.

Tóth, A., Karaffa, E., Kovács, C.: Isolation and identification of fungi from vine rootstock.
In: The International Conference for Students - Student in Bucovina Abstract book, Stefan cel Mare University of Suceava, Romania, Bucovina, 30, 2016.

Kovács, C., Csótó, A., Rakonczás, N., Karaffa, E.: Mikroklimatikus viszonyok szerepe a szőlő tőkebetegségeinek tünet megjelenésére.
In: LVIII. Georgikon Napok, [Pannon Egyetem, Georgikon Kar], [Keszthely], 184-191, 2016.

Kovács, C., Csótó, A., Rakonczás, N., Karaffa, E.: Mikroklimatikus viszonyok szerepe a szőlő tőkebetegségeinek tünet megjelenésére.
In: LVIII. Georgikon Napok : Kivonat-kötet : Programfüzet, valamint az elhangzó és poszter előadások rövid kivonatainak gyűjteménye, Pannon Egyetem, Georgikon Kar, Keszthely, 90, 2016. ISBN: 9789639639843

Bujáki, B., Mihály, K., Bérczesné Szojka, A., Kovács, C., Takács, F., Karaffa, E.: Preharvest treatments of sour cherries to extend self-life.
In: The International Conference for Students - Student in Bucovina Abstract book, Stefan cel Mare University of Suceava, Romania, Bucovina, 31, 2016.

Mihály, K., Kovács, C., Bujáki, B., Takács, F., Karaffa, E.: Preharveszt kezelések hatása a friss fogyasztású meggy tárolhatóságára.
In: Integrált termesztés a kertészeti és szántóföldi kultúrákban, XXXIII.. Szerk.: Nagy Géza, Novák Róbert, Ripka Géza, Magyar Növényvédelmi Társaság, Budapest, 33-43, 2016. ISBN: 9789638969040

Csótó, A., Kovács, C., Karaffa, E., Rakonczás, N.: Survey and examination of GTD-s and isolation of pathogens in the grapevine variety collection of the University of Debrecen.
In: Meeting of Young Researchers from V4 Countries Abstract book. Ed.: Monika Wesołowska, University of Rzeszow, Rzeszow, 20, 2016.

Kovács, C., Karaffa, E.: The increasing importance of Grapevine Trunk Diseases.
Int. J. Hortic. Sci. 22 (3-4), 21-30, 2016.

Karaffa, L., Diaz, R., Papp, B., Fekete, E., Karaffa, E., Kubicek, C.: A deficiency of manganese ions in the presence of high sugar 5 concentrations is the critical parameter for achieving high yields 6 of itaconic acid by Aspergillus terreus.
Appl. Microbiol. Biotechnol. 99 (19), 7937-7944, 2015.

Kovács, C., Karaffa, E., Balling, P., Bihari, Z., Peles, F.: Application of Trichoderma strains against GTD pathogens.
In: FEMS Congress of European Microbiologists : Abstract book, [Federation of European Microbiological Societies], [Maastricht], 87, 2015.

Bihari, Z., Balling, P., Éles, S., Kovács, C., Karaffa, E.: A szőlő fás betegségeinek hatása a szőlőtermelésre a Tokaji Borvidéken.
In: Szőlészeti és Borászati Tudományos Konferencia. Szerk.: Horváth Cs., Viniczai S, Magyar Mezőgazdaság Kft., Budapest, 25, 2015.

Kovács, C., Peles, F., Bihari, Z., Karaffa, E.: A szőlő tőkeelhalásában szerepet játszó patogén gombák arányának változása 2013-2014 között a Tokaji borvidéken.
In: 61. Növényvédelmi Tuodmányos Napok. Szerk.: Horváth József, Haltrich Attila, Molnár János, Magyar Növényvédelmi Társaság, Budapest, 47, 2015.

Kovács, C., Balling, P., Peles, F., Éles, S., Bihari, Z., Karaffa, E.: A tőkeelhalásban szerepet játszó patogén gombák és a szőlőtőkékben lévő egyéb endofita gombák jelenlétének változása 2013-2014 között a Tokaji borvidéken.
In: Szőlészeti és Borászati Tudományos Konferencia. Szerk.: Horváth Cs., Viniczai S, Magyar Mezőgazdaság Kft., Budapest, 48, 2015.

Karaffa, E., Bérczesné Szojka, A.: Bacterial and yeast molecular biology.
University of Debrecen Faculty of Agricultural and Food Science and Environmental Management Institute of Food Science, Debrecen, 48 p., 2015. ISBN: 9789634738305

Kovács, C., Peles, F., Karaffa, E.: Different Trichoderma isolates as potential biopesticide in field experiments.
In: Student in Bucovina Abstracts :International Conference for Students "Student in Bucovina" May, 7th-9th, 2015, Faculty of Food Engineering, Stefan cel Mare University of Suceava, Suceava, 153, 2015

Görcsös, G., Irinyi, L., Radócz, L., Tarcali, G., Karaffa, E.: Diversity of Cryphonectria parasitica populations from the Carpathian Basin.
Acta Microbiol. Immunol. Hung. 62 (3), 247-266, 2015.

Karaffa, E., Peles, F.: Élelmiszer minőség és biztonság mikrobiológiai vonatkozásai.
Debreceni Egyetem Mezőgazdaság-, Élelmiszertudományi és Környezetgazdálkodási Kar Élelmiszertudományi Intézet, Debrecen, 150 p., 2015. ISBN: 9789634738329

Kovács, C., Balling, P., Karaffa, E., Bihari, Z., Rey, P., Peles, F.: Endophytes and pathogens isolated from symptomatic and asymptomatic (Grapevine Trunk Diseases) woody tissues of Chardonnay, from the Tokaj wine region in Hungary.
In: Cost Action FA 1303 Workshop - "Grapevine trunk diseases: current state and future prospects" : Abstract book, [COST], [Cognac], 14, 2015.

Kovács, C., Peles, F., Karaffa, E.: Endophytic fungi isolated from GTD symptomatic grapevines and testing potential biocontrol agents for treatment.
Acta Microbiol. Immunol. Hung. 62 (Suppl.), 168-169, 2015.

Kovács, C., Peles, F., Balling, P., Bihari, Z., Karaffa, E.: GTD tüneteket mutató és tünetmentes szőlőtőkék endofita mikroflórája.
In: Georgikon Napok konferenciakötet [elektronikus dokumentum] : 2015-ös előadások, Pannon Egyetem, [Keszthely], 210-218, 2015. ISBN: 9789639639829

Kovács, C., Peles, F., Balling, P., Bihari, Z., Karaffa, E.: GTD tüneteket mutató és tünetmentes szőlőtőkék endofita mikroflórájának összehasonlítása.
In: LVII. Georgikon Napok = 57th Georgikon Scientific Conference : kivonat-kötet : programfüzet, valamint az elhangzó és poszter előadások rövid kivonatainak gyűjteménye : [agrárgazdaság a növekedéskor után] : [2015. október 1-2., Keszthely], Pannon Egyetem, [Keszthely], 74, 2015. ISBN: 9789639639812

Kovács, C., Peles, F., Karaffa, E.: Potential biopesticide against GTD pathogens isolated from asymptomatic grapevines.
In: XVIII. International Plant Protection Congress Berlin, 24-28 August 2015. Program and Book of Abstracts. Ed.: Falko Feldmann, E. A. Short Heinrichs, [International Association for the Plant Protection Sciences], Berlin, 444, 2015. ISBN: 9783981650877

Kovács, C., Peles, F., Bihari, Z., Karaffa, E.: Presence of Grapevine Trunk Diseases in 2013 and 2014 in the Tokaj wine region, Hungary.
In: Cost Action FA 1303 Workshop - "Grapevine trunk diseases: current state and future prospects" : Abstract book, [COST], [Cognac], 8, 2015.

Peles, F., Kovács, C., Bérczesné Szojka, A., Bihari, Z., Karaffa, E.: Species identification of wine cellar mould derived from the Tokaj wine region, Hungary.
Acta Microbiol. Immunol. Hung. 62 (Suppl.), 88, 2015.

Kovács, C., Balling, P., Peles, F., Karaffa, E.: Trichoderma treatments in Hungarian vineyards.
In: Cost Action FA 1303 Workshop - "Grapevine trunk diseases: current state and future prospects" : Abstract book, [COST], [Cognac], 49, 2015.

Kovács, C., Peles, F., Xie, H., Bihari, Z., Karaffa, E.: A fertőző tőkeelhalásban részt vevő kórokozó gombák izolálása a Tokaji borvidékről.
In: 60. Növényvédelmi Tudományos Napok. Szerk.: Horváth József, Haltrich Attila, Molnár János, Magyar Növényvédelmi Társaság, Budapest, 106, 2014.

Kovács, C., Peles, F., Bihari, Z., Karaffa, E.: A fertőző tőkeelhalásban szerepet játszó gombák vizsgálata a Tokaj-Hegyaljai Borvidéken.
In: Az átalakuló, alkalmazkodó mezőgazdaság és vidék : XIV. Nemzetközi Tudományos Napok : Gyöngyös, 2014. március 27-28. : tanulmányok [elektronikus dokumentum]. Szerk.: Takácsné György Katalin, Károly Róbert Főiskola, Gyöngyös, 843-848, 2014. ISBN: 9789639941762

Bihari, Z., Kovács, C., Balling, P., Fischinger, R., Éles, S., Peles, F., Karaffa, E.: A korai tőkeelhalás kutatása a Tokaji Borvidék Szőlészeti és Borászati Kutatóintézetben.
Szőlő-levél 4 (1), 5-6, 2014.

Bihari, Z., Kovács, C., Balling, P., Fischinger, R., Éles, I., Peles, F., Karaffa, E.: A korai tőkeelhalás kutatása a Tokaji Borvidék Szőlészeti és Borászati Kutatóintézetben.
In: XV. Szőlészeti és Borászati Konferencia. Szerk.: Zsófi Zsolt, Váczy Kálmán Zoltán, Károly Róbert Főiskola, Eger, 51, 2014. ISBN: 9789639941748

Kovács, C., Karaffa, E., Peles, F.: Analysis of mycelial growth rate and mycoparasitic ability of different Trichoderma isolates from grapevine trunks.
Anal. Univ. Oradea Fac. Pretect. Med. 22 (19), 13-20, 2014.

Kovács, C., Peles, F., Xie, H., Bérczesné Szojka, A., Hajdu, G., Bihari, Z., Karaffa, E.: A szőlő fertőző tőkeelhalásban szerepet játszó gombák izolálása és azonosítása hagyományos és molekuláris biológiai módszerekkel a Tokaj-hegyaljai borvidéken.
Agrártud. közl. 56 61-66, 2014.

Kovács, C., Peles, F., Bihari, Z., Karaffa, E.: A szőlő tőkebetegségeiben szerepet játszó gombák a Tokaj-Hegyaljai borvidéken.
Növényvédelem. 50 (4), 153-159, 2014.

Kovács, C., Peles, F., Karaffa, E.: Az Eutypa lata által termelt eutypin toxikus vegyület és hatásai, az eutípás tőkeelhalás.
Szőlő-levél 4 (5), 7-10, 2014.

Kovács, C., Peles, F., Karaffa, E.: Biológiai védekezési lehetőség a szőlő fás megbetegedései ellen.
Szőlő-levél 4 (2), 13-14, 2014.

Kovács, C., Karaffa, E., Bihari, Z., Peles, F.: Endophytic and pathogenic fungi associated with Grapevine Trunk Diseases in the Tokaj wine region, Hungary: In: Abstracts of oral and poster presentations given at the 9th International Workshop on Grapevine Trunk Diseases, Adelaide, Australia, 18-20 November 2014.
Phytopathol. Mediterr. 53 (3), 566, 2014.

Kovács, C., Karaffa, E., Balling, P., Bihari, Z., Peles, F.: Examination of different Trichoderma isolates as potential biopesticide in laboratory and field experiments: In: Abstracts of oral and poster presentations given at the 9th International Workshop on Grapevine Trunk Diseases, Adelaide, Australia, 18-20 November 2014.
Phytopathol. Mediterr. 53 (3), 585, 2014.

Jónás, Á., Fekete, E., Flipphi, M., Karaffa, E., Jäger, S., Molnár, Á., Szentirmai, A., Karaffa, L.: Extra- and intracellular lactose catabolism in Penicillium chrysogenum: phylogenetic and expression analysis of the putative permease and hydrolase genes.
J. Antibiot. 67 489-497, 2014.

Kovács, C., Bérczesné Szojka, A., Bihari, Z., Karaffa, E., Peles, F.: Grapevine trunk diseases in the Tokaj wine region, Hungary.
Integr. Food. Nutr. Metab. 1 (1), 60, 2014.

Görcsös, G., Irinyi, L., Tarcali, G., Radócz, L., Karaffa, E.: Kárpát medencei Cryphonectria parasitica (MURRILL) M.E BARR izolátumok mikroszatellit vizsgálata BAPS program segítségével.
Georgicon Agric. 19 (1), 57-62, 2014.

Kovács, C., Karaffa, E., Bihari, Z., Peles, F.: Molecular characterization of GTD endophytic and pathogenic fungi.
Biokémia. 38 (3), 74, 2014.

Kovács, C., Karaffa, E., Peles, F.: Mycelial growth rate and mycoparasitic potential of Trichoderma harzianum isolates against Fusarium oxysporum from grapevine.
Acta Microbiol. Immunol. Hung. 62 (Suppl.), 47-48, 2014.

Peles, F., Kovács, C., Bérczesné Szojka, A., Bihari, Z., Forgony, E., Karaffa, E.: Néhány Tokaj környéki pincészetből származó pincepenész azonosítása.
Szőlő-levél 4 (9), 14-17, 2014.

Kovács, C., Karaffa, E., Peles, F.: Szőlőtőkékből izolált endofita Trichoderma izolátumok micéliális növekedése és kompetíciós képessége.
In: 56. Georgikon Napok : kivonat-kötet : programfüzet, valamint az elhangzó és poszter előadások rövid kivonatainak gyűjteménye, PE Georgikon Kar, [Keszthely], 84, 2014. ISBN: 9789639639591

Kovács, C., Karaffa, E., Peles, F.: Szőlőtőkékből izolált endofita Trichoderma izolátumok micéliális növekedése és kompetíciós képessége.
In: Georgikon Napok konfereciakötet [elektronikus dokumentum] : 2014-es előadások, Pannon Egyetem, [Keszthely], 180-187, 2014. ISBN: 9789639639607

Kovács, C., Peles, F., Balling, P., Bihari, Z., Karaffa, E.: Szőlőtőkékből izolált Trichoderma fajok vizsgálata laboratóriumi és szabadföldi kísérletben.
In: Integrált termesztés a kertészeti és szántóföldi kultúrákban XXXI.. Szerk.: Gál Péter, Novák Róbert, Pánczél Milán, Ripka Géza, Magyar Növényvédelmi Társaság, Budapest, 5-11, 2014. ISBN: 9789638969026

Karimi Aghcheh, R., Németh, Z., Atanasova, L., Fekete, E., Paholcsek, M., Karaffa, E., Aquino, B., Druzhinina, I., Karaffa, L., Kubicek, C.: The VELVET A orthologue VEL1 of Trichoderma reesei regulates fungal development and is essential for cellulase gene expression.
PLoS One. 9 (11), e112799-1 - e112799-10, 2014.

Kovács, C., Kovács, B., Pepó, P., Csajbók, J., Karaffa, E., Peles, F.: Az elővetemény, a növényvédelmi kezelések és a tápanyagutánpótlás hatása a búza penészgomba fertőzöttség kialakulására.
In: Fiatal kutatók az egészséges élelmiszerért : tudományos ülés. Szerk.: Bódi Éva, Fekete István, Kovács Béla, Debreceni Egyetem Hankóczy Jenő Növénytermesztési, Kertészeti és Élelmiszertudományok Doktori Iskola, Debrecen, 129-134, 2013. ISBN: 9789634736011

Asadollahi, M., Fekete, E., Karaffa, L., Flipphi, M., Árnyasi, M., Esmaeili, M., Váczy, K., Karaffa, E.: Comparison of Botrytis cinerea populations isolated from two open-field cultivated host plants.
Microbiol. Res. 168 379-388, 2013.

Peles, F., Kovács, C., Kovács, B., Pepó, P., Csajbók, J., Borbélyné Varga, M., Szilágyi, S., Karaffa, E.: Effect of different forecrop, fertilizer and plant protection treatment on the mould contamination of wheat.
In: The influence of some technological elements over the wheat and corn grains quality stored in Bihor and Hajdu Bihar counties. Ed.: Csajbók József, Debreceni Egyetem ATC Mezőgazdaságtudományi Kar, Debrecen, 61-66, 2013. ISBN: 9789634736127

Karaffa, E., Xie, H., Kovács, C., Bérczesné Szojka, A., Bihari, Z., Peles, F.: First taxonomical survey of fungi isolated from Grapevine Trunk Diseases in the Tokaj wine region, Hungary.
Acta Microbiol. Immunol. Hung. 60 (Suppl.), 223-224, 2013.

Lehoczki, A., Sipos, P., Peles, F., Kovács, C., Karaffa, E.: Fungicides kezelések hatása őszi búza fajták minőségi paramétereire.
In: Fiatal kutatók az egészséges élelmiszerért : tudományos ülés. Szerk.: Bódi Éva, Fekete István, Kovács Béla, Debreceni Egyetem Hankóczy Jenő Növénytermesztési, Kertészeti és Élelmiszertudományok Doktori Iskola, Debrecen, 202-207, 2013. ISBN: 9789634736011

Kovács, C., Kovács, B., Pepó, P., Csajbók, J., Borbélyné Varga, M., Szilágyi, S., Karaffa, E., Peles, F.: Fusarium- and DON toxin contamination of wheat samples from Látókép.
In: The influence of some technological elements over the wheat and corn grains quality stored in Bihor and Hajdu Bihar counties. Ed.: Csajbók József, Debreceni Egyetem ATC Mezőgazdaságtudományi Kar, Debrecen, 37-42, 2013. ISBN: 9789634736127

Görcsös, G., Irinyi, L., Karaffa, E., Tarcali, G., Radócz, L.: Közép európai Cryphonectria parasitica izolátumok mikroszatellit vizsgálata.
In: XXIII. Keszthelyi Növényvédelmi Fórum : 2013. január 23-25., Keszthely, PE GK Növényvédelmi Int., Keszthely, 205-210, [2013].

Kövics, G., Karaffa, E., Rai, M., Irinyi, L.: Phoma-like fungi on soybeans.
Crit. Rev. Microbiol. 40 (1), 49-62, 2013.

Asadollahi, M., Bérczesné Szojka, A., Fekete, E., Karaffa, L., Takács, F., Flipphi, M., Karaffa, E.: Resistance to QoI Fungicide and Cytochrome b Diversity in the Hungarian Botrytis cinerea Population.
J. Agric. Sci. Technol. 15 397-407, 2013.

Kovács, C., Peles, F., Karaffa, E.: Tokaj-Hegyaljáról izolált, korai tőkeelhalásban szerepet játszó Botryosphaeria gombák.
Szőlő-levél 3 (9), 3-4, 2013.

Asadollahi, M., Bódi, Z., Peles, F., Karaffa, E.: Antifungal activity of anthocyanins from purple field corn cob against Botrytis cinerea and Fusarium species.
J. Agric. Sci. 50 42-44, 2012.

Fekete, E., De Vries, R., Seiboth, B., Kuyk, P., Karaffa, E., Fekete, É., Metz, B., Kubicek, C., Karaffa, L.: D-galactose uptake is non-functional in the conidiospores of Aspergillus niger.
FEMS Microbiol. Lett. 329 198-203, 2012.

Fekete, É., Fekete, E., Irinyi, L., Karaffa, L., Árnyasi, M., Asadollahi, M., Karaffa, E.: Genetic diversity of a Botrytis cinerea cryptic species complex in Hungary.
Microbiol. Res. 167 283-291, 2012.

Kovács, C., Pepó, P., Csajbók, J., Borbélyné Varga, M., Szilágyi, S., Karaffa, E., Peles, F.: Látóképi kísérletekből származó búzaminták penészgomba-, Fusarium- és DON toxin szennyezettségének alakulása.
J. Agric. Sci. 50 76-83, 2012.

Bérczesné Szojka, A., Asadollahi, M., Fekete, É., Fekete, E., Karaffa, L., Karaffa, E.: Magyarországi Botrytis cinerea izolátumok azoxystrobin rezisztenciájának vizsgálata real-time PCR technika segítségével.
Agrártud. közl. 43 41-44, 2011.

Portnoy, T., Margeot, A., Linke, R., Atanasova, L., Fekete, E., Karaffa, E., Hartl, L., Karaffa, L., Druzhinina, I., Seiboth, B., Le Crom, S., Kubicek, C.: The CRE1 carbon catabolite repressor of the fungus Trichoderma reesei: a master regulator of carbon assimilation.
BMC Genomics. 12 (269), 1-12, 2011.

Asadollahi, M., Fekete, É., Fekete, E., Karaffa, L., Irinyi, L., Karaffa, E.: Magyarországi Botrytis cinerea izolátumok citokróm b génjének diverzitása.
Agrártud. közl. 39 18-21, 2010.

Irinyi, L., Gade, A., Rai, M., Kövics, G., Karaffa, E.: Morphology and Molecular Biology of Phoma.
In: Current Advances in Molecular Mycology / editors Youssuf Gherbawy, Robert Ludwig Mach, Mahendra Rai, Nova Science Publishers, New York, 171-204, 2009.

Irinyi, L., Kövics, G., Karaffa, E.: Taxonomical re-evaluation of Phoma-like soybean pathogenic fungi.
Mycol. Res. 113 (2), 249-260, 2009.

Irinyi, L., Karaffa, E.: Bayesian inference in the phylogenetics of Phoma taxons.
Cereal Res. Commun. 36 (Suppl.II), 1091-1094, 2008.

Váczy, K., Karaffa, E., Karaffa, L., Fekete, E., Fekete, É., Árnyasi, M., Czeglédi, L., Kövics, G., Druzhinina, I., Kubicek, C.: Sexual Recombination in the Botrytis cinerea populations in Hungarian Vineyards.
Phytopathol. 98 (12), 1312-1319, 2008.

Váczy, K., Karaffa, L., Kövics, G., Gál, L., Rudó, N., Karaffa, E.: A Botrytis cinerea transzpozon elemeinek és micéliális kompatibilitási csoportjainak vizsgálata az Egri és Tokaji borvidékeken.
In: Vas Károly Tudományos Ülésszak: összefoglalók. Élelmiszertudományi Kar / Barta József (elnök); Badakné Kerti Katalin (tag, és mások), Budapesti Corvinus Egyetem, Budapest, 98-98, 2007. ISBN: 9789630633505

Kövics, G., Szarukán, I., Karaffa, E., Radócz, L., Szarvas, P., Tarcali, G., Dávid, I., Bozsik, A., Irinyi, L.: A lucerna védelme I.: a lucerna kórtana, a gyökér és a lombozat állati kártevői.
Növényvédelem. 43 (4), 119-137, 2007.

Kövics, G., Irinyi, L., Bozsik, A., Dávid, I., Szarukán, I., Radócz, L., Karaffa, E., Szarvas, P., Tarcali, G.: A lucerna védelme II.: a lucerna magkártevői, gyomirtása és a védelem.
Növényvédelem. 43 (5), 189-199, 2007.

Irinyi, L., Kövics, G., Karaffa, E.: A Phylogenetic study on different Phoma species.
Acta Microbiol. Immunol. Hung. 54 (Suppl.), 51, 2007.

Irinyi, L., Karaffa, E., Kövics, G.: Classification of Phoma species using new phylogenetic marker.
Analele Universitatii din Oradea. Fascicula Agricultura-Horticultura 12 (12), 91-97, 2007.

Kubicek, C., Komon-Zelazowska, M., Karaffa, E., Druzhinina, I.: Facts and challenges in the understanding of the biosynthesis of peptaibols by Trichoderma.
Chem. Biodivers. 4 (6), 1068-1082, 2007.

El, -., Karaffa, E., Irinyi, L., Kövics, G.: Mycoparasitism and antagonistic efficiency of Trichoderma reesei against Botrytis spp.
In: Sesiunea Stiintifica Actualitati in Biologia Vegetala

Irinyi, L., Karaffa, E., Kövics, G.: Phoma fajok filogenetikai vizsgálata.
Agrártud. közl. 26 100-107, 2007.

Váczy, K., Karaffa, L., Karaffa, E., Kövics, G.: Szürkerothadást okozó botrytis cinerea populációk jellemzése miniszatellit-szekvencia vizsgálatával.
Növényvédelem. 43 (2), 57-61, 2007.

Irinyi, L., El, -., Karaffa, E., Kövics, G.: Trichoderma reesei - Biológiai védekezési lehetőség a Phoma fajok ellen.
In: XVII. Keszthelyi Növényvédelmi Fórum Kiadványa, Keszthely, 2007. január 31-február 2.. Szerk.: Fischl Géza, [Keszthelyi Egyetem], [Keszthely], 19-22, 2007.

Ilyés, H., Karaffa, L., Fekete, É., Karaffa, E., Szentirmai, A., Kubicek, C.: CreA-mediated carbon catabolite repression of [beta]-galactosidase formation in Aspergillus nidulans is growth rate dependent.
FEMS Microbiol. Lett. 235 147-151, 2004.

Karaffa, E., Seiboth, B., Karaffa, L., Fekete, E., Irinyi, L., Kövics, G., Kubicek, C.: Riporter rendszer létrehozása a Trichoderma reesei peptaibol szintetáz expressziójának analíziséhez.
In: 9. Tiszántúli Növényvédelmi Fórum: A szomszédé valóban zöldebb? : a növényvédők első tapasztalatai Magyarországon, mint az EU tagországában: Előadások - Proceedings. Szerk.: Kövics György, Debreceni Egyetem, Debrecen, 232-237, 2004. ISBN: 9639274798

Fekete, E., Karaffa, L., Karaffa, E., Bányai, I., Seiboth, B., Gyémánt, G., Sepsi, A., Szentirmai, A., Kubicek, C.: The alternative D-galactose degrading pathway of Aspergillus nidulans proceeds via L-sorbose.
Arch. Microbiol. 181 (1), 35-44, 2004.

Nagy, M., Emri, T., Fekete, E., Karaffa, E., Springael, J., Penninckx, M., Pócsi, I.: Glutathione Metabolism of Acremonium chrysogenum in Relation to Cephalosporin C Production: Is gamma -Glutamyltransferase in the Center?.
Folia Microbiol. 48 (2), 149-155, 2003.

Karaffa, E., Fekete, E., Karaffa, L.: Regulation of the cyanide-resistant alternative respiratory pathway in the fungus Acremonium chrysogenum.
Food Technol. Biotechnol. 41 (1), 43-47, 2003.

Karaffa, L., Karaffa, E., Fekete, E., Kozma, J., Szentirmai, A., Pócsi, I.: Stimulation of the cyanide-resistant alternative respiratory pathway by oxygen in Acremonium chrysogenum correlates with the size of the intracellular peroxide pool.
Can. J. Microbiol. 49 (3), 216-220, 2003.

Karaffa, L., Fekete, E., Karaffa, E., Sepsi, A., Seiboth, B., Szentirmai, A., Kubicek, C.: Carbon catabolite repression in the regulation of beta-galactosidase activity in Aspergillus nidulans..
Acta Microbiol. Immunol. Hung. 49 (2/3), 261-265, 2002.

Fekete, E., Karaffa, L., Karaffa, E., Seiboth, B., Biró, S., Szentirmai, A., Kubicek, C.: Regulation of formation of the intracellular β-galactosidase activity of Aspergillus nidulans.
Arch. Microbiol. 179 (1), 7-14, 2002.

Seiboth, B., Karaffa, L., Karaffa, E., Kubicek, C.: The Hypocrea jecorina gal10 (UDP-glucose 4-epimerase-encoding) gene differs from yeast homologues in sequence, genomic organization and expression.
Gene. 295 143-149, 2002.

Karaffa, E., Juhász, A., Szentirmai, A., Karaffa, L.: A metabolikus aktivitás becslése Akridinnarancs fluoreszcens festékkel.
Acta biol. Debr. 22 69-74, 2001.

Karaffa, E., Szentirmai, A., Paul, G., Thomas, C., Pócsi, I., Karaffa, L.: Analysis of the relationship between growth, cephalosporin C production and fragmentation in Acremonium chrysogenum..
Can. J. Microbiol. 47 (9), 801-806, 2001.

Fekete, E., Karaffa, L., Karaffa, E., Seiboth, B., Szentirmai, A., Kubicek, C.: Beta-galactosidase formation in Aspergillus nidulans.
Med. Fac. Landbouww. Univ. Gent 66/3a 285-286, 2001.

Karaffa, L., Váczy, K., Karaffa, E., Biró, S., Szentirmai, A., Pócsi, I.: Cyanide-resistant alternative respiration is strictly correlated to intracellular peroxide levels in Acremonium chrysogenum.
Free Radic. Res. 34 (4), 405-416, 2001.

Karaffa, L., Karaffa, E., Fekete, E., Szentirmai, A.: The biochemistry of citric acid accumulation by Aspergillus niger.
Acta Microbiol. Immunol. Hung. 48 (3/4), 429-441, 2001.

Karaffa, E., Karaffa, L., Paul, G., Pócsi, I., Thomas, C., Szentirmai, A.: Assessment of the metabolic activity of Acremonium chrysogenum using Acridine Orange.
Biotechnol. Lett. 22 693-697, 2000.

Karaffa, E., Fekete, E., Karaffa, L., Szentirmai, A.: Effect of sulphurcontaining amino acids on the glutathione metabolism and cephalosporin C production of Acremonium chrysogenum.

Karaffa, E., Szentirmai, A., Biró, S., Karaffa, L.: Specific cephalosporin C production of Acremonium chrysogenum is independent of the culture density.
Biotechn. Techn. 13 (7), 443-445, 1999.

Karaffa, L., Karaffa, E., Kozma, J., Kubicek, C., Szentirmai, A.: The role of the alternative respiratory pathway in the stimulation of cephalosporin C formation by soybean oil in Acremonium chrysogenum.
Appl. Microbiol. Biotechnol. 51 633-638, 1999.

Karaffa, E., Pusztahelyi, T., Karaffa, L., Karányi, Z., Pócsi, I., Biró, S., Szentirmai, A., Pócsi, I.: Allosamidin inhibits the fragmentation of Acremonium chrysogenum but does not influence the cephalosporin-C production of the fungus.
FEMS Microbiol. Lett. 164 (2), 231-236, 1998.

Nógrády, N., Pócsi, I., Paffard, S., Katona, É., Miles, R., Balázs, A., Karaffa, E., Fachet, J., Price, R., Szentirmai, A.: Development of ELISA and enzyme-linked immunofiltration assay (ELIFA) methods for monitoring cyclodextrin glycosyltransferase (CGTase) production and bacterial growth in Bacillus macerans batch cultures.
J. Biotechnol. 60 (1-2), 15-22, 1998.

Karaffa, E., Karaffa, L., Krahe, M., Märkl, H., Szentirmai, A.: Dializáló membránreaktor alkalmazása nagy sejtsűrűségű Acremonium chrysogenum tenyészet létrehozására.
Membrántechnika 2 3-11, 1998.

Karaffa, L., Karaffa, E., Kozma, J., Szentirmai, A.: Methionine enhances sugar consumption, fragmentation, vacuolation and cephalosporin C production in Acremonium chrysogenum.
Process Biochem. 32 (6), 495-499, 1997.

Karaffa, L., Karaffa, E., Kozma, J., Szentirmai, A.: Cephalosporin C production, morphology and alternative respiration of Acremonium chrysogenum in glucose-limited chemostat.
Biotechnol. Lett. 18 (6), 701-106, 1996.