Gyöngyösi, E., László, B., Szalmás, A., Kónya, J., Veress, G.: Transcriptional activity of the long control region in human papillomavirus type 33 intratype variants.
Virol. J. 20 (1), 1-10, 2023.

László, B., Antal, L., Gyöngyösi, E., Szalmás, A., Póliska, S., Veress, G., Kónya, J.: Coordinated Action of Human Papillomavirus Type 16 E6 and E7 Oncoproteins on Competitive Endogenous RNA (ceRNA) network members in Primary Human Keratinocytes.
BMC Cancer. 21 (1), 673, 2021.

Szilágyi-Tolnai, E., Fauszt, P., Fidler, G., Pesti-Asbóth, G., Szilágyi, E., Stágel, A., Kónya, J., Szabó, J., Stündl, L., Babinszky, L., Gálné Remenyik, J., Biró, S., Paholcsek, M.: Nutraceuticals Induced Changes in the Broiler Gastrointestinal Tract Microbiota.
mSystems. 6 (2), 1-25, 2021.

Nagy, G., Tudlik, Z., Gergely, L., Kónya, J., Orosi, P., Rákóczi, É., Szabó, J., Várvölgyi, C., Vitális, E., Paragh, G.: A székletmikrobiota-transzplantáció technológiájának és minőségirányítási hátterének újragondolása a SARS-CoV-2 víruspandémia kapcsán.
Orv. hetil. 161 (44), 1858-1871, 2020.

Gyöngyösi, E., Szalmás, A., Kónya, J., Veress, G.: Orientation-dependent toxic effect of human papillomavirus type 33 long control region DNA in Escherichia coli cells.
Virus Genes. 56 (3), 298-305, 2020.

Kolozsvári, L., Kónya, J., Paget, J., Schellevis, F., Sándor, J., Szőllősi, G., Kolozsváriné Harsányi, S., Jancsó, Z., Rurik, I.: Patient-related factors, antibiotic prescribing and antimicrobial resistance of the commensal Staphylococcus aureus and Streptococcus pneumoniae in a healthy population - Hungarian results of the APRES study.
BMC Infect Dis. 19 1-8, 2019.

Sipka, S., Zilahi, E., Papp, G., Chen, J., Nagy, A., Dull, K., Kónya, J., Zeher, M.: Down-regulation of increased TRAF6 expression in the peripheral mononuclear cells of patients with primary Sjögren's syndrome by an EBV-EBER1-specific synthetic single-stranded complementary DNA molecule.
Int. J. Rheum. Dis. 20 (5), 614-621, 2017.

Szalmás, A., Tomaić, V., Basukala, O., Massimi, P., Mittal, S., Kónya, J., Banks, L.: The PTPN14 tumour suppressor is a degradation target of Human Papillomavirus E7.
J. Virol. 91 (7), 1-13, 2017.

Kónya, J.: Antivirális gyógyszerek.
In: Fertőző betegségek : egyetemi tankönyv. Szerk.: Maródi László, Medicina, Budapest, 99-105, 2016. ISBN: 9789632265230

László, B., Ferenczi, A., Madar, L., Gyöngyösi, E., Szalmás, A., Szakács, L., Veress, G., Kónya, J.: CpG methylation in human papillomavirus (HPV) type 31 long control region (LCR) in cervical infections associated with cytological abnormalities.
Virus Genes. 52 (4), 552-555, 2016.

Ferenczi, A., Gyöngyösi, E., Szalmás, A., László, B., Kónya, J., Veress, G.: Phylogenetic and functional analysis of sequence variation of human papillomavirus type 31 E6 and E7 oncoproteins.
Infection, Genetics and Evolution. 43 94-100, 2016.

Kónya, J.: Szerológiai vizsgáló módszerek.
In: Fertőző betegségek : egyetemi tankönyv. Szerk.: Maródi László, Medicina, Budapest, 61-70, 2016. ISBN: 9789632265230

Paholcsek, M., Fidler, G., Kónya, J., Rejtő, L., Méhes, G., Bukta, E., Loeffler, J., Biró, S.: Combining standard clinical methods with PCR showed improved diagnosis of invasive pulmonary aspergillosis in patients with hematological malignancies and prolonged neutropenia.
BMC Infect. Dis. 15 (1), 251, 2015.

Gyöngyösi, E., Szalmás, A., Ferenczi, A., Póliska, S., Kónya, J., Veress, G.: Transcriptional regulation of genes involved in keratinocyte differentiation by human papillomavirus 16 oncoproteins.
Arch. Virol. 160 (2), 389-398, 2015.

Ötvös, R., Juhász, A., Szalai, E., Újvári, D., Ötvös, K., Szabó, K., Remenyik, É., Székely, L., Gergely, L., Kónya, J.: Molecular Typing of Human Herpesvirus 8 Isolates from Patients with Kaposi's Sarcoma in Hungary.
Anticancer Res. 34 (2), 893-898, 2014.

Kovács, R., Czudar, A., Horváth, L., Szakács, L., Majoros, L., Kónya, J.: Serum interleukin-6 levels in murine models of Candida albicans infection.
Acta Microbiol. Immunol. Hung. 61 (1), 61-69, 2014.

Szalmás, A., Gyöngyösi, E., Ferenczi, A., László, B., Karosi, T., Csomor, P., Gergely, L., Veress, G., Kónya, J.: Activation of Src, Fyn and Yes non-receptor tyrosine kinases in keratinocytes expressing human papillomavirus (HPV) type 16 E7 oncoprotein.
Virol. J. 10 (1), 79, 2013.

Hernádi, K., Gyöngyösi, E., Mészáros, B., Szakács, L., Szalmás, A., Csoma, E., Mogyorósi, R., Czompa, L., Veress, G., Varga, I., Márton, I., Kónya, J.: Elevated Tumor Necrosis Factor-alpha Expression in Periapical Lesions Infected by Epstein-Barr Virus.
J. Endod. 39 (4), 456-460, 2013.

Szalmás, A., Papp, Z., Csomor, P., Kónya, J., Sziklai, I., Szekanecz, Z., Karosi, T.: Microbiological Profile of Adenoid Hypertrophy Correlates to Clinical Diagnosis in Children.
BioMed Res. Int. 2013 629607, 2013.

Ferenczi, A., Gyöngyösi, E., Szalmás, A., Hernádi, Z., Tóth, Z., Kónya, J., Veress, G.: Sequence variation of human papillomavirus Type 31 long control region: phylogenetic and functional implications.
J. Med. Virol. 85 (5), 852-859, 2013.

Orosi, P., Szidor, J., Tóthné Tóth, T., Kónya, J.: A(H1N1)v-influenzaesetek a Debreceni Egyetem Orvos- és Egészségtudományi Centrumában a 2009/2010. évi és a 2010/2011. évi influenzaszezonban.
Orv. Hetil. 153 (17), 649-654, 2012.

Kónya, J.: A bőr, az izomzat és a vázrendszer fertőzéseinek klinikai mikrobiológiája.
In: Az orvosi mikrobiológia tankönyve. Szerk.: Pál Tibor, Medicina Könyvkiadó Zrt., Budapest, 505-508, 2012. ISBN: 9789632263533

Kónya, J.: Adenovírusok.
In: Az orvosi mikrobiológia tankönyve. Szerk.: Pál Tibor, Medicina Könyvkiadó Zrt., Budapest, 182-186, 2012. ISBN: 9789632263533

Kónya, J.: Antibiotikumok és kemoterápiás szerek.
In: Az orvosi mikrobiológia tankönyve. Szerk.: Pál Tibor, Medicina Könyvkiadó Zrt., Budapest, 128-136, 2012. ISBN: 9789632263533

Kónya, J.: A vírusok genetikája.
In: Az orvosi mikrobiológia tankönyve. Szerk.: Pál Tibor, Medicina Könyvkiadó Zrt., Budapest, 35-37, 2012. ISBN: 9789632263533

Gyöngyösi, E., Szalmás, A., Ferenczi, A., Kónya, J., Gergely, L., Veress, G.: Effects of human papillomavirus (HPV) type 16 oncoproteins on the expression of involucrin in human keratinocytes.
Virol. J. 9 36, 2012.

Kónya, J.: Fogászati fertőzések klinikai mikrobiológiája.
In: Az orvosi mikrobiológia tankönyve. Szerk.: Pál Tibor, Medicina Könyvkiadó Zrt., Budapest, 529-532, 2012. ISBN: 9789632263533

Hernádi, K., Szalmás, A., Mogyorósi, R., Czompa, L., Veress, G., Csoma, E., Márton, I., Kónya, J.: Herpeszvírusok előfordulása humán periodontitis apicalis mintákban.
Fogorv. Szle. 105 (4), 135-140, 2012.

Kónya, J.: Humán herpesvírusok.
In: Az orvosi mikrobiológia tankönyve. Szerk.: Pál Tibor, Medicina Könyvkiadó Zrt., Budapest, 173-182, 2012. ISBN: 9789632263533

Kónya, J.: Parvovírusok.
In: Az orvosi mikrobiológia tankönyve. Szerk.: Pál Tibor, Medicina Könyvkiadó Zrt., Budapest, 191-193, 2012. ISBN: 9789632263533

Kónya, J.: Részletes virológia.
In: Az orvosi mikrobiológia tankönyve. Szerk.: Pál Tibor, Medicina Könyvkiadó Zrt., Budapest, 171-173, 2012. ISBN: 9789632263533

László, B., Kónya, J., Dandár, E., Deák, J., Farkas, Á., Gray, J., Grósz, G., Iturriza-Gomara, M., Jakab, F., Juhász, Á., Kisfali, P., Kovács, J., Lengyel, G., Martella, V., Melegh, B., Mészáros, J., Molnár, P., Nyúl, Z., Papp, H., Pátri, L., Puskás, E., Sántha, I., Schneider, F., Szomor, K., Tóth, A., Tóth, E., Szűcs, G., Bányai, K.: Surveillance of human rotaviruses in 2007-2011, Hungary: exploring the genetic relatedness between vaccine and field strains.
J. Clin. Virol. 55 (2), 140-146, 2012.

Hernádi, K., Csoma, E., Ádám, B., Szalmás, A., Gyöngyösi, E., Veress, G., Márton, I., Kónya, J.: Association of human herpesvirus 6 subtypes with symptomatic apical periodontitis.
Oral Surg. Oral Med. Oral Pathol. Oral Radiol. Endod. 112 (3), 401-406, 2011.

Csoma, E., Mészáros, B., Gáll, T., Asztalos, L., Kónya, J., Gergely, L.: Dominance of variant A in human Herpesvirus 6 viraemia after renal transplantation.
Virol. J. 8 403, 2011.

Ötvös, R., Skribek, H., Kis, L., Gloghini, A., Márkász, L., Flaberg, E., Eksborg, S., Kónya, J., Gergely, L., Carbone, A., Székely, L.: Drug sensitivity patterns of HHV8 carrying body cavity lymphoma cell lines.
BMC Cancer. 11 441, 2011.

Kónya, J.: Nukleinsav diagnosztika.
In: Klinikai és járványügyi virológia. Szerk.: Takács Mária, Vox Medica Kiadó Kft., Budapest, 141-144, 2011. ISBN: 9789639740204

Karosi, T., Csomor, P., Szalmás, A., Kónya, J., Petkó, M., Sziklai, I.: Osteoprotegerin expression and sensitivity in otosclerosis with different histological activity.
Eur. Arch. Oto-Rhino-Laryn. 268 (3), 357-365, 2011.

Kónya, J.: Papillomaviridae.
In: Klinikai és járványügyi virológia. Szerk.: Takács Mária, Vox Medica Kiadó Kft., Budapest, 367-378, 2011. ISBN: 9789639740204

Csoma, E., Mészáros, B., Asztalos, L., Kónya, J., Gergely, L.: Prevalence of WU and KI polyomaviruses in plasma, urine, and respiratory samples from renal transplant patients.
J. Med. Virol. 83 (7), 1275-1278, 2011.

Csomor, P., Szalmás, A., Kónya, J., Karosi, T., Sziklai, I.: Az otosclerosisra jellemző CD46 variánsok molekuláris biológiai jellemzése.
Fül-Orr-Gégegyógy. 56 (1), 221-230, 2010.

Szalmás, A., Kónya, J., Sziklai, I., Karosi, T.: Detection and identification of CD46 splicing isoforms by nested RT-PCR.
Methods Mol. Biol. 630 (1), 83-95, 2010.

Hernádi, K., Szalmás, A., Mogyorósi, R., Czompa, L., Veress, G., Csoma, E., Márton, I., Kónya, J.: Prevalence and Activity of Epstein-Barr Virus and Human Cytomegalovirus in Symptomatic and Asymptomatic Apical Periodontitis Lesions.
J. Endod. 36 (9), 1485-1489, 2010.

Csomor, P., Szalmás, A., Kónya, J., Sziklai, I., Karosi, T.: Restriction analysis of otosclerosis-associated CD46 splicing variants.
Eur. Arch. Otorhinolaryngol. 267 (2), 219-226, 2010.

Szalmás, A., Kónya, J.: Epigenetic alterations in cervical carcinogenesis.
Semin. Cancer Biol. 19 (3), 144-152, 2009.

László, B., Nyúl, Z., Kisfali, P., Deák, J., Kovács, J., Kónya, J., Mészner, Z., Molnár, P., Pátri, L., Schneider, F., Tóth, A., Melegh, B., Iturriza-Gomara, M., Gray, J., Martella, V., Szűcs, G., Bányai, K.: First detection of P[6],G9 rotaviruses in Hungary: an imported strain from India?.
J. Travel Med. 16 (2), 141-143, 2009.

Szabó, J., Dombrádi, Z., Dobay, O., Orosi, P., Kónya, J., Nagy, K., Rozgonyi, F.: Phenotypic and genetic characterisation of methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains isolated from the university hospitals of Debrecen.
Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 28 (2), 129-136, 2009.

László, B., Czellár, E., Deák, J., Juhász, Á., Kovács, J., Kónya, J., Mészáros, J., Mészner, Z., Mihály, I., Molnár, P., Nyúl, Z., Pátri, L., Puskás, E., Schneider, F., Siffel, C., Tóth, A., Tóth, E., Szűcs, G., Bányai, K.: Posztvakcinációs rotavírus-surveillance Magyarországon, 2007.
Orv. Hetil. 150 (31), 1443-1450, 2009.

Karosi, T., Csomor, P., Szalmás, A., Kónya, J., Z. Szabó, L., Liktor, B., Petkó, M., Pytel, J., Jóri, J., Sziklai, I.: Új, otosclerosis-specifikus CD46 variánsok: az otosclerosisos csontátépülés genetikai alapja?.
Fül-Orr-Gégegyógy. 55 (1), 17-27, 2009.

Sápy, T., Póka, R., Szarka, K., Kónya, J., Huga, S., Hernádi, Z.: Age-specific prevalence of high-risk human papillomavirus infection in a Hungarian female population with positive cytology.
Eur. J. Obstet. Gynecol. Reprod. Biol. 138 (2), 194-198, 2008.

Karosi, T., Szalmás, A., Csomor, P., Kónya, J., Petkó, M., Sziklai, I.: Disease-associated novel CD46 splicing variants and pathologic bone remodeling in otosclerosis.
Laryngoscope. 118 (9), 1669-1676, 2008.

Szalmás, A., Bánáti, F., Koroknai, A., László, B., Fehér, E., Salamon, D., Gergely, L., Minárovits, J., Kónya, J.: Lineage-specific silencing of human IL-10 gene expression by promoter methylation in cervical cancer cells.
Eur. J. Cancer. 44 (7), 1030-1038, 2008.

Kónya, J., Molnár, S., Magyar, M., Szekeres, C., Kerényi, L., Csiba, L.: Severity of carotid atherosclerosis unrelated to chlamydia pneumoniae infection in acute ischemic stroke patients: a clinicopathological Study.
Cerebrovasc. Dis. 25 (1-2), 170-175, 2008.

Szabó, J., Kónya, J.: Az orális ökoszisztéma mikrobiológiája.
In: Orális mikrobiológia, immunitástan, diagnosztika és infekciókontroll. Szerk.: Rozgonyi Ferenc, Kónya József, Medicina Kiadó, Budapest, 75-94, 2007. ISBN: 9789632261232

Karosi, T., Jókay, I., Kónya, J., Petkó, M., Z. Szabó, L., Sziklai, I.: Expression of measles virus receptors in otosclerotic, non-otosclerotic and in normal stapes footplates.
Eur. Arch. Otorhinolaryngol. 264 (6), 607-613, 2007.

Bányai, K., Deák, J., Gray, J., Iturriza-Gomara, M., Kovács, J., Kónya, J., László, B., Martella, V., Mészner, Z., Mihály, I., Molnár, P., Nyúl, Z., Pátri, L., Schneider, F., Tóth, A., Szűcs, G.: Hazai részvétellel megalakult az Európai Rotavírustörzs-figyelő Hálózat (EuroRotaNet).
Orv. Hetil. 148 (43), 2043-2045, 2007.

Karosi, T., Kónya, J., Z. Szabó, L., Sziklai, I.: Measles virus prevalence in otosclerotic foci.
Adv. Otorhinolaryngol. 65 93-106, 2007.

Dombrádi, Z., Bodnár, F., Borbély, Á., Péterffy, Á., Kónya, J., Orosi, P., Dombrádi, V., Szabó, J.: Molecular analysis of vancomycin resistant enterococcus faecalis strain isolated in Debrecen.
Acta Microbiol. Immunol. Hung. 54 (Suppl), 26, 2007.

Gera, I., Barna, Z., Kövesi, G., Szabó, J., Kónya, J., Nagy, G.: Parodontális fertőzések.
In: Orális mikrobiológia, immunitástan, diagnosztika és infekciókontroll. Szerk.: Rozgonyi Ferenc, Kónya József, Medicina Kiadó, Budapest, 86-94, 2007. ISBN: 9789632261232

Borbély, Á., Murvai, M., Szarka, K., Kónya, J., Gergely, L., Hernádi, Z., Veress, G.: Survivin promoter polymorphism and cervical carcinogenesis.
J. Clin. Pathol. 60 (3), 303-306, 2007.

Karosi, T., Jókay, I., Kónya, J., Petkó, M., Z. Szabó, L., Pytel, J., Jóri, J., Sziklai, I.: Activated Osteoclasts with CD51/61 Expression in Otosclerosis.
Laryngoscope. 116 (8), 1478-1484, 2006.

Kónya, J.: A humán papillomavírus (HPV) diagnosztikai helye az anogenitális carcinomák megelőzésében.
Infekt. Klin. Mikrobiol. 13 107-113, 2006.

Karosi, T., Kónya, J., Petkó, M., Z. Szabó, L., Pytel, J., Jóri, J., Sziklai, I.: Antimeasles Immunoglobulin G for Serologic Diagnosis of Otosclerotic Hearing Loss.
Laryngoscope. 116 (3), 488-493, 2006.

Karosi, T., Kónya, J., Petkó, M., Z. Szabó, L., Pytel, J., Jóri, J., Sziklai, I.: Az otosclerosis által okozott halláscsökkenés szerológiai diagnózisa.
Fül-, Orr-, Gégegyógy. 52 (1), 47-54, 2006.

Karosi, T., Jókay, I., Kónya, J., Z. Szabó, L., Pytel, J., Jóri, J., Szalmás, A., Sziklai, I.: Az otosclerosisos csontátépülés molekuláris háttere.
Fül-Orr-Gégegyógy. 52 (2), 176-183, 2006.

Karosi, T., Kónya, J., Petkó, M., Z. Szabó, L., Pytel, J., Jóri, J., Sziklai, I.: CD51/61 expressziót mutató, aktivált osteoclastok az otosclerosisos csontban.
Fül-, Orr-, Gégegyógy. 52 (3), 168-175, 2006.

Karosi, T., Jókay, I., Kónya, J., Z. Szabó, L., Pytel, J., Jóri, J., Szalmás, A., Sziklai, I.: Detection of Osteoprotegerin and TNF-alpha mRNA in Ankylotic Stapes Footplates in Connection With Measles Virus Positivity.
Laryngoscope. 116 (8), 1427-1433, 2006.

Hernádi, Z., Gazdag, L., Szőke, K., Sápy, T., Krasznai, Z., Kónya, J.: Duration of HPV-associated risk for high-grade cervical intraepithelial neoplasia.
Eur. J. Obstet. Gynecol. Reprod. Biol. 125 (1), 114-119, 2006.

Borbély, Á., Murvai, M., Kónya, J., Beck, Z., Gergely, L., Li, F., Veress, G.: Effects of human papillomavirus type 16 oncoproteins on survivin gene expression.
J. Gen. Virol. 87 (2), 287-294, 2006.

Csoma, E., Deli, T., Kónya, J., Csernoch, L., Beck, Z., Gergely, L.: Human herpesvirus 6A decreases the susceptibility of macrophages to R5 variants of human immunodeficiency virus 1: possible role of RANTES and IL-8.
Virus Res. 121 (2), 161-168, 2006.

Karosi, T., Jókay, I., Kónya, J., Petkó, M., Z. Szabó, L., Sziklai, I.: Kanyaróvírus receptor expresszió otosclerosisos, nem otosclerosisos és egészséges stapes talpakban.
Fül-Orr-Gégegyógy. 52 (4), 236-244, 2006.

Majoros, L., Szegedi, I., Kardos, G., Erdész, C., Kónya, J., Kiss, C.: Slow response of invasive Candida krusei infection to amphotericin B in a clinical time-kill study.
Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 25 (12), 803-806, 2006.

Karosi, T., Kónya, J., Petkó, M., Sziklai, I.: A kanyaróvírus csak a szövettanilag otosclerosisnak bizonyult stapes talpakban mutatható ki.
Fül-, Orr-, Gégegyógy. 51 (3), 125-133, 2005.

Karosi, T., Kónya, J., Petkó, M., Z. Szabó, L., Pytel, J., Jóri, J., Szalmás, A., Sziklai, I.: A kanyaróvírus és a tumor nekrózis faktor-alfa mRNS együttes expressziója otoscelerosisos stapes talpakban.
Fül-, Orr-, Gégegyógy. 51 (3), 134-140, 2005.

Karosi, T., Kónya, J., Z. Szabó, L., Pytel, J., Szabó, I., Jóri, J., Sziklai, I.: A kanyaróvírus szerepe az otosclerosis pathogenesisében.
Fül-,Orr-,Gégegyógy. 51 (1), 8-14, 2005.

Karosi, T., Kónya, J., Z. Szabó, L., Pytel, J., Jóri, J., Szalmás, A., Sziklai, I.: Codetection of Measles Virus and Tumor Necrosis Factor-Alpha mRNA in Otosclerotic Stapes Footplates.
Laryngoscope. 115 (7), 1291-1297, 2005.

Kónya, J., Beck, Z.: Fogorvosi jelentőségű baktériumok: Gram-pozitív coccusok.
In: Fogorvosi mikrobiológia. Szerk.: Kónya József, Szabó Judit, Veress György, Beck Zoltán, Szarka Krisztina, Debreceni Egyetem Orvos és Egészségtudományi Centrum Elnöki Hivatal, Debrecen, 67-109, 2005.

Kónya, J., Tóth, F.: Fogorvosi mikrobiológia I.: egyetemi jegyzet.
Debreceni Egyetem Orvos és Egészségtudományi Centrum Elnöki Hivatal, Debrecen, 150 p., 2005.

Szládek, G., Juhász, A., Kardos, G., Szőke, K., Major, T., Sziklai, I., Tar, I., Márton, I., Kónya, J., Gergely, L., Szarka, K.: High co-prevalence of genogroup 1 TT virus and human papillomavirus is associated with poor clinical outcome of laryngeal carcinoma.
J. Clin. Pathol. 58 (4), 402-405, 2005.

Karosi, T., Kónya, J., Petkó, M., Sziklai, I.: Histologic otosclerosis is associated with the presence of measles virus in the stapes footplate.
Otol. Neurotol. 26 (6), 1128-1133, 2005.

Hernádi, Z., Szőke, K., Sápy, T., Krasznai, Z., Soós, G., Veress, G., Gergely, L., Kónya, J.: Role of human papillomavirus (HPV) testing in the follow-up of patients after treatment for cervical precancerous lesions.
Eur. J. Obstet. Gynecol. Reprod. Biol. 118 (2), 229-234, 2005.

Karosi, T., Kónya, J., Petkó, M., Z. Szabó, L., Pytel, J., Jóri, J., Sziklai, I.: Two Subgroups of Stapes Fixation: otosclerosis and Pseudo-Otosclerosis.
Laryngoscope. 115 (11), 1968-1973, 2005.

Murvai, M., Borbély, Á., Kónya, J., Gergely, L., Veress, G.: Effect of human papillomavirus type 16 E6 and E7 oncogenes on the activity of the transforming growth factor-beta2 (TGF-beta2) promoter.
Arch. Virol. 149 (12), 2379-2392, 2004.

Szőke, K., Szalmás, A., Szládek, G., Veress, G., Gergely, L., Tóth, F., Kónya, J.: IL-10 Promoter nt-1082A/G Polymorphism and Human Papillomavirus Infection in Cytologic Abnormalities of the Uterine Cervix.
J. Interferon Cytokine Res. 24 (4), 245-251, 2004.

Karosi, T., Kónya, J., Z. Szabó, L., Sziklai, I.: Measles virus prevalence in otosclerotic stapes footplate samples.
Otol. Neurotol. 25 (4), 451-456, 2004.

Karosi, T., Kónya, J., Szabó, Z., Pytel, J., Szabó, I., Jóri, J., Szűcs, A., Sziklai, I.: The role of measles virus in the pathogenesis of otosclerosis (P21).
In: Inner Ear Biology Workshop. Ed.: Sziklai István, University of Debrecen, Debrecen, 22, 2004.

Beck, Z., Bácsi, A., Liu, X., Ebbesen, P., Andirkó, I., Csoma, E., Kónya, J., Nagy, E., Tóth, F.: Differential patterns of human cytomegalovirus gene expression in various T-cell lines carrying human T-cell leukemia-lymphoma virus type I: role of tax-activated cellular transcription factors.
J. Med. Virol. 71 (1), 94-104, 2003.

Nagy, E., Beck, Z., Kiss, A., Csoma, E., Telek, B., Kónya, J., Oláh, É., Rák, K., Tóth, F.: Frequent methylation of p16(INK4A) and p14(ARF) genes implicated in the evolution of chronic myeloid leukaemia from its chronic to accelerated phase.
Eur. J. Cancer. 39 (16), 2298-2305, 2003.

Szőke, K., Sápy, T., Krasznai, Z., Hernádi, Z., Szládek, G., Veress, G., Dillner, J., Gergely, L., Kónya, J.: Moderate variation of the oncogenic potential among high-risk human papillomavirus types in gynecologic patients with cervical abnormalities.
J. Med. Virol. 71 (4), 585-592, 2003.

Szládek, G., Juhász, A., Asztalos, L., Szőke, K., Murvai, M., Szarka, K., Veress, G., Gergely, L., Kónya, J.: Persisting TT virus (TTV) genogroup 1 variants in renal transplant recipients.
Arch. Virol. 148 (5), 841-851, 2003.

Bánhegyi, D., Bácsi, A., Tóth, F., Prohászka, Z., Horváth, A., Beck, Z., Kónya, J., Füst, G.: Significant decrease of the enhancement/neutralization index in HIV patients during highly active antiretroviral therapy (HAART).
Immunol. Lett. 89 (1), 25-30, 2003.

Csoma, E., Bácsi, A., Liu, X., Szabó, J., Ebbesen, P., Beck, Z., Kónya, J., Andirkó, I., Nagy, E., Tóth, F.: Human herpesvirus 6 variant A infects human term syncytiotrophoblast in vitro and induces replication of human immunodeficiency virus type 1 in dually infected cells.
J. Med. Virol. 67 (1), 67-87, 2002.

Kónya, J.: Szubvirális kórokozók.
In: Általános mikrobiológia. Szerk.: D. Tóth Ferenc, Debreceni Egyetem, Debrecen, 136-143, 2002.

Kónya, J.: Vírusellenes hatóanyagok.
In: Általános mikrobiológia. Szerk.: D. Tóth Ferenc, Debreceni Egyetem, Debrecen, 78-90, 2002.

Juhász, A., Kónya, J., Beck, Z., Remenyik, É., Veress, G., Bégány, Á., Medgyessy, I., Hunyadi, J., Gergely, L.: HHV-8 ELISA based on a one-step affinity capture of biotinilated K8.1 antigen.
J. Virol. Methods. 94 (1-2), 163-172, 2001.

Szőke, K., Szládek, G., Szarka, K., Juhász, A., Veress, G., Gergely, L., Kónya, J.: Human cytomegalovirus load in the peripheral blood determined by quantitative competitive polymerase chain reaction.
Acta Microbiol. Immunol. Hung. 48 (3), 313-321, 2001.

Sápy, T., P. Szikszay, Á., Kónya, J., Borsos, A., Hernádi, Z.: Humán papillomavírus-infekció prevalenciája közel ötéves anyagunkban.
Orv. Hetil. 142 (24), 1265-1268, 2001.

Kónya, J., Dillner, J.: Immunity to oncogenic human papillomaviruses.
Adv.Cancer Res. 82 205-238, 2001.

Bácsi, A., Csoma, E., Beck, Z., Andirkó, I., Kónya, J., Gergely, L., Tóth, F.: Induction of HIV-1 replication in latently infected syncytiotrophoblast cells by contact with placental macrophages: role of interleukin-6 and tumor necrosis factor-alpha.
J. Interferon Cytokine Res. 21 (12), 1079-1088, 2001.

Juhász, A., Remenyik, É., Kónya, J., Veress, G., Bégány, Á., Andirkó, I., Medgyessy, I., Hunyadi, J., Gergely, L.: Prevalence and age distribution of human herpesvirus-8 specific antibodies in Hungarian blood donors.
J. Med. Virol. 64 (4), 526-530, 2001.

Veress, G., Murvai, M., Szarka, K., Juhász, A., Kónya, J., Gergely, L.: Transcriptional activity of human papillomavirus type 16 variants having deletions in the long control region.
Eur. J. Cancer. 37 (15), 1946-1952, 2001.

Kónya, J., Veress, G., Juhász, A., Szarka, K., Sápy, T., Hernádi, Z., Gergely, L.: Additional human papillomavirus types detected by the hybrid capture tube test among samples from women with cytological and colposcopical atypia.
J. Clin. Microbiol. 38 (1), 408-411, 2000.

Szarka, K., Veress, G., Juhász, A., Kónya, J., Sápy, T., Soós, G., Hernádi, Z., Gergely, L.: Integration status of virus DNA and p53 codon 72 polymorphism in human papillomavirus type 16 positive cervical cancers.
Anticancer Res. 20 (3B), 2161-2167, 2000.

Sápy, T., Hernádi, Z., Kónya, J., Lukácskó, L.: Poor clinical outcome in early stage cervical cancer with human papillomavirus-18 positive lymph nodes.
Eur. J. Obstet. Gynecol. Reprod. Biol. 90 (1), 93-95, 2000.

Szarka, K., Veress, G., Kónya, J., Gergely, L.: Frequency of p53 codon 72 genotypes in human papillomavirus associated squamous intraepithelial lesions and cervical cancer.
Anticancer Res. 19 (3B), 2377-2379, 1999.

Wang, Z., Kónya, J., Avall-Lundkvist, E., Sapp, M., Dillner, J., Dillner, L.: Human papillomavirus antibody responses among patients with incident cervical carcinoma.
J. Med. Virol. 52 (4), 436-440, 1997.

Kónya, J., Eklund, C., af Geijersstam, V., Yuan, F., Stuber, G., Dillner, J.: Identification of a cytotoxic T-lymphocyte epitope in the human papillomavirus type 16 E2 protein.
J. Gen. Virol. 78 (Pt10), 2615-2620, 1997.

Hernádi, Z., Sápy, T., Kónya, J., Veress, G., Czeglédy, J.: Magas kockázatú humán papillomavírus (HPV)-pozitív, méhnyakrákos betegek kórlefolyásának követése.
Orv. Hetil. 138 (20), 1249-1253, 1997.

Kónya, J., Stuber, G., Björndal, A., Fenyö, E., Dillner, J.: Primary induction of human cytotoxic lymphocytes against a synthetic peptide of the human immunodeficiency virus type 1 protease.
J. Gen. Virol. 78 (Pt9), 2217-2224, 1997.

Veress, G., Csiky-Mészáros, T., Kónya, J., Czeglédy, J., Gergely, L.: Follow-up of human papillomavirus (HPV) DNA and local anti-HPV antibodies in cytologically normal pregnant women.
Med. Microbiol. Immunol. 185 (3), 139-144, 1996.

Kónya, J., Veress, G., Hernádi, Z., Soós, G., Czeglédy, J., Gergely, L.: Correlation of human papillomavirus 16 and 18 with prognostic factors in invasive cervical neoplasias.
J. Med. Virol. 46 (1), 1-6, 1995.

Veress, G., Kónya, J., Csiky-Mészáros, T., Czeglédy, J., Gergely, L.: Human papillomavirus DNA and anti-HPV secretory IgA antibodies in cytologically normal cervical specimens.
J. Med. Virol. 43 (2), 201-207, 1994.