Mándi, A., Rimóczi, A., Vasas, A., Hohmann, J., Swamy, M., Monde, K., Barta, R., Kicsák, M., Komáromi, I., Fehér, K., Kurtán, T.: Testing the Simplified Molecular Dynamics Approach to Improve the Reproduction of ECD Spectra and Monitor Aggregation.
Int. J. Mol. Sci. 25 (12), 1-18, 2024.

Potor, L., Hendrik, Z., Patsalos, A., Katona, É., Méhes, G., Póliska, S., Csősz, É., Kalló, G., Komáromi, I., Combi, Z., Posta, N., Sikura, K., Pethő, D., Oros, M., Vereb, G., Tóth, C., Gergely, P., Nagy, L., Balla, G., Balla, J.: Oxidation of hemoglobin drives a proatherogenic polarization of macrophages in human atherosclerosis.
Antioxid. Redox Signal. 35 (12), 917-950, 2021.

Fekete, A., Komáromi, I., Mucs, D.: On the early events of the calcium induced activation of coagulation factor XIII-A2 and tissue transglutaminase: an in silico study.
J. Biomol. Struct. Dyn. 38 (1), 152-167, 2020.

Balogh, G., Komáromi, I., Bereczky, Z.: The mechanism of high affinity pentasaccharide binding to antithrombin, insights from Gaussian accelerated molecular dynamics simulations.
J. Biomol. Struct. Dyn. 38 (16), 4718-4732, 2020.

Balogh, G., Muszbek, L., Komáromi, I.: First Step of the Transglutaminase Reaction Catalyzed by Activated Factor XIII Subunit A, Hybrid Quantum Chemistry/Molecular Mechanics Calculations.
J. Phys. Chem. B. 123 (18), 3887-3897, 2019.

Fizil, Á., Sonderegger, C., Czajlik, A., Fekete, A., Komáromi, I., Hajdu, D., Marx, F., Batta, G.: Calcium binding of the antifungal protein PAF: Structure, dynamics and function aspects by NMR and MD simulations.
PLoS One. 13 (10), 1-19, 2018.

Nánási, P., Komáromi, I., Gaburjakova, M., Almássy, J.: Omecamtiv Mecarbil: a Myosin Motor Activator Agent with Promising Clinical Performance and New in vitro Results.
Curr. Med. Chem. 25 (15), 1720-1728, 2018.

Nánási, P., Komáromi, I., Almássy, J.: Perspectives of a myosin motor activator agent with increased selectivity.
Can. J. Physiol. Pharmacol. 96 (7), 676-680, 2018.

Selmeczi, A., Gindele, R., Ilonczai, P., Fekete, A., Komáromi, I., Schlammadinger, Á., Molnárné Rázsó, K., Kovács, K., Bárdos, H., Ádány, R., Muszbek, L., Bereczky, Z., Boda, Z., Oláh, Z.: Antithrombin Debrecen (p.Leu205Pro) - Clinical and molecular characterization of a novel mutation associated with severe thrombotic tendency.
Thromb. Res. 158 1-7, 2017.

Gindele, R., Selmeczi, A., Oláh, Z., Ilonczai, P., Pfliegler, G., Marján, E., Nemes, L., Nagy, Á., Losonczy, H., Mitic, G., Kovac, M., Balogh, G., Komáromi, I., Schlammadinger, Á., Molnárné Rázsó, K., Boda, Z., Muszbek, L., Bereczky, Z.: Clinical and laboratory characteristics of antithrombin deficiencies: a large cohort study from a single diagnostic center.
Thromb. Res. 160 119-128, 2017.

Sárközi, S., Komáromi, I., Jóna, I., Almássy, J.: Lanthanides Report Calcium Sensor in the Vestibule of Ryanodine Receptor.
Biophys. J. 112 (10), 2127-2137, 2017.

Fekete, A., Komáromi, I.: Modeling the archetype cysteine protease reaction using dispersion corrected density functional methods in ONIOM-type hybrid QM/MM calculations: the proteolytic reaction of papain.
Phys. Chem. Chem. Phys. 18 (48), 32847-32861, 2016.

Eszenyi, D., Mándi, A., Herczeg, M., Bényei, A., Komáromi, I., Borbás, A.: Synthesis of C-2- and C-3-Sulfonatomethyl O- and S-Glycosides by Horner-Wadsworth-Emmons Olefination.
Eur. J. Org. Chem. 2016 (22), 3884-3893, 2016.

Bereczki, I., Mándi, A., Rőth, E., Borbás, A., Fizil, Á., Komáromi, I., Sipos, A., Kurtán, T., Batta, G., Ostorházi, E., Rozgonyi, F., Vanderlinden, E., Naesens, L., Sztaricskai, F., Herczegh, P.: A few atoms make the difference: Synthetic, CD, NMR and computational studies on antiviral and antibacterial activities of glycopeptide antibiotic aglycon derivatives.
Eur. J. Med. Chem. 94 73-86, 2015.

Tóth, L., Fekete, A., Balogh, G., Bereczky, Z., Komáromi, I.: Dynamic properties of the native free antithrombin from molecular dynamics simulations: computational evidence for solvent- exposed Arg393 side chain.
J. Biomol. Struct. Dyn. 33 (9), 2023-2036, 2015.

Szalóki, N., Krieger, J., Komáromi, I., Tóth, K., Vámosi, G.: Evidence for Homodimerization of the c-Fos Transcription Factor in Live Cells Revealed by Fluorescence Microscopy and Computer Modeling.
Mol. Cell. Biol. 35 (21), 3785-3798, 2015.

Gyöngyösi, T., Komáromi, I., Kövér, K.: Heparin-analóg pentaszacharidok antitrombin-III fehérjével való kölcsönhatásának összehasonlítása nmr spektroszkópiai módszerek és molekuladinamikai számítások segítségével.
In: XXXVIII. Kémiai Előadói Napok : Program és előadás-összefoglalók. Szerk.: Bohner Bíborka, Mesterházy Edit, JATEPress, Szeged, 150-151, 2015. ISBN: 9789639970649

Kovács, K., Pataki, I., Bárdos, H., Fekete, A., Pfliegler, G., Haramura, G., Gindele, R., Komáromi, I., Balla, G., Ádány, R., Muszbek, L., Bereczky, Z.: Molecular characterization of p.Asp77Gly and the novel p.Ala163Val and p.Ala163Glu mutations causing protein C deficiency.
Thromb. Res. 135 (4), 718-726, 2015.

Bereczky, Z., Kovács, K., Bárdos, H., Pataki, I., Balla, G., Pfliegler, G., Haramura, G., Komáromi, I., Ádány, R., Muszbek, L.: Diagnostic considerations based on the experience of genetic analysis in Protein C deficiency and molecular characterization of different mutations.
Clin. Chem. Lab. Med. 52 (9), eA68-eA69, 2014.

Kovács, B., Pataki, I., Bárdos, H., Pfliegler, G., Komáromi, I., Fekete, A., Haramura, G., Ádány, R., Balla, G., Muszbek, L., Bereczky, Z.: Molecular Characterization of Novel Protein C Mutations (p.Asp77Gly, p.Ala163Val and p.Ala163Glu) Causing Protein C Deficiency.
Thromb. Res. 133 S11-, 2014.

Németh, I., Kiss-Szikszai, A., Gulácsi, K., Mándi, A., Komáromi, I., Kurtán, T., Antus, S.: Oxidation of enol acetate of flavanone with thallium(III) nitrate or phenyliodonium diacetate: a convenient new route to isoflavone and flavone.
Monatsh. Chem. 145 (5), 849-855, 2014.

Bokor, É., Fekete, A., Varga, G., Szőcs, B., Czifrák, K., Komáromi, I., Somsák, L.: C-(β-d-Glucopyranosyl)formamidrazones, formic acid hydrazides and their transformations into 3-(β-d-glucopyranosyl)-5-substituted-1,2,4-triazoles: a synthetic and computational study.
Tetrahedron. 69 (48), 10391-10404, 2013.

Kiss, A., Bécsi, B., Kolozsvári, B., Komáromi, I., Kövér, K., Erdődi, F.: Epigallocatechin-3-gallate and penta-O-galloyl-β-D-glucose inhibit protein phosphatase-1.
FEBS J. 280 (2), 612-626, 2013.

Timári, I., Komáromi, I., Fehér, K., Kövér, K.: Heparin-analóg pentaszacharidok szerkezete és antitrombin III fehérjével való kölcsönhatása: NMR vizsgálatok és elméleti számítások.
In: Pro Scientia Aranyérmesek XI. Konferenciája : Szeged, 2012. november 8-10. : előadások. Szerk.: Szőllősi László, Pro Scientia Aranyérmesek Társ., Budapest, 119-123, 2013. ISBN: 9789638828927

Tóth, L., Muszbek, L., Komáromi, I.: Mechanism of the irreversible inhibition of human cyclooxygenase-1 by aspirin as predicted by QM/MM calculations.
J. Mol. Graph. 40 99-109, 2013.