Tudóstér: Miskei Márton publikációi

Pákozdi, K., Antal, K., Miskei, M., Szabó, Z., Pócsi, I., Emri, T.: Aspergillus fumigatus és Aspergillus nidulans sodB géndeléciós mutánsainak oxidatív stresszre adott válaszának összehasonlító transzkriptomikai vizsgálata = Comparative transcriptomic analysis of the oxidative stress response of sodB gene deletion mutants of Aspergillus fumigatus and A. nidulans.
In: VII. Magyar Mikológiai Konferencia : Absztraktkötet. Szerk.:: Dima Bálint; Papp Viktor, MATE, Magyar Mikológiai Társaság, 2024, 26-27, 2024. ISBN: 9789636230982(pdf)

Pákozdi, K., Antal, K., Pázmándi, K., Miskei, M., Szabó, Z., Pócsi, I., Emri, T.: Resynthesis of Damaged Fe-S Cluster Proteins Protects Aspergillus fumigatus Against Oxidative Stress in the Absence of Mn-Superoxide Dismutase.
J. Fungi. 10 1-16, 2024.

Vig, I., Benkő, Z., Gila, B., Palczert, Z., Jakab, Á., Nagy, F., Miskei, M., Lee, M., Yu, J., Pócsi, I., Emri, T.: Functional characterization of genes encoding cadmium pumping P1B-type ATPases in Aspergillus fumigatus and Aspergillus nidulans.
Microbiol Spectr. 11 (5), 1-14, 2023.

Pócsi, I., Pákozdi, K., Miskei, M., Benkő, Z., Papp, L., Pusztahelyi, T., Virág, E.: Recent results in Fusarium verticillioides research at the University of Debrecen.
In: 7th International Conference on Emerging Trends and Innovations in Biotechnology BIOSPECTRUM 2023: Souvenir and Abstracts, School of Biosciences, Mar Athanasios College For Advanced Studies Tiruvalla (MACFAST), Tiruvalla, Kerala, India, 19, 2023.

Bodnár, V., Király, A., Orosz, E., Miskei, M., Emri, T., Karányi, Z., Leiter, É., De Vries, R., Pócsi, I.: Species-specific effects of the introduction of Aspergillus nidulans gfdB in osmophilic aspergilli.
Appl. Microbiol. Biotechnol. 107 ((2023),), 2423-2436, 2023.

Karányi, Z., Mosolygó, Á., Feró, O., Horváth, A., Boros-Oláh, B., Nagy, É., Hetey, S., Holb, I., Szaker, H., Miskei, M., Csorba, T., Székvölgyi, L.: NODULIN HOMEOBOX is required for heterochromatin homeostasis in Arabidopsis.
Nat Comms. 13 1-20, 2022.

Miskei, M., Horváth, A., Viola, L., Varga, L., Nagy, É., Feró, O., Karányi, Z., Roszik, J., Miskey, C., Ivics, Z., Székvölgyi, L.: Genome-wide mapping of binding sites of the transposase-derived SETMAR protein in the human genome.
Computational and Structural Biotechnology Journal. 19 4032-4041, 2021.

Szabó, K., Miskei, M., Farkas, I., Dombrádi, V.: The phosphatome of opportunistic pathogen Candida species.
Fungal Biology Reviews. 35 40-51, 2021.

Szabó, Z., Hornyák, L., Miskei, M., Székvölgyi, L.: Two targets, one hit: new anticancer therapeutics to prevent tumorigenesis without cardiotoxicity.
Front. Pharmacol. 11 1-5, 2021.

Miskei, M., Horváth, A., Vendruscolo, M., Fuxreiter, M.: Sequence-Based Prediction of Fuzzy Protein Interactions.
J. Mol. Biol. 432 (7), 2289-2303, 2020.

Horváth, A., Miskei, M., Ambrus, V., Vendruscolo, M., Fuxreiter, M.: Sequence-based prediction of protein binding mode landscapes.
PLoS Comput. Biol. 16 (5), 1-19, 2020.

Selbmann, L., Benkő, Z., Coleine, C., de Hoog, S., Donati, C., Druzhinina, I., Emri, T., Ettinger, C., Gladfelter, A., Gorbushina, A., Grigoriev, I., Grube, M., Gunde-Cimerman, N., Karányi, Z., Kocsis, B., Kubressoian, T., Miklós, I., Miskei, M., Muggia, L., Northen, T., Novak-Babič, M., Pennacchio, C., Pfliegler, V., Pócsi, I., Prigione, V., Riquelme, M., Segata, N., Schumacher, J., Shelest, E., Sterflinger, K., Tesei, D., U'Ren, J., Varese, G., Vázquez-Campos, X., Vicente, V., Souza, E., Zalar, P., Walker, A., Stajich, J.: Shed Light in the DaRk LineagES of the Fungal Tree of Life-STRES.
Life (Basel). 10 (12), 1-13, 2020.

Emri, T., Antal, K., Riley, R., Karányi, Z., Miskei, M., Orosz, E., Baker, S., Wiebenga, A., De Vries, R., Pócsi, I.: Duplications and losses of genes encoding known elements of the stress defence system of the Aspergilli contribute to the evolution of these filamentous fungi but do not directly influence their environmental stress tolerance.
Stud. Mycol. 91 23-36, 2018.

De Vries, R., Riley, R., Wiebenga, A., Aguilar-Osorio, G., Amillis, S., Akemi Uchima, C., Anderluh, G., Asadollahi, M., Askin, M., Barry, K., Battaglia, E., Bayram, Ö., Benocci, T., Braus-Stromeyer, S., Caldana, C., Cánovas, D., Cerqueira, G., Chen, F., Chen, W., Choi, C., Clum, A., Corrêa dos, S., Lima Damásio, A., Diallinas, G., Emri, T., Fekete, E., Flipphi, M., Freyberg, S., Gallo,, A., Gournas, C., Habgood, R., Hainaut, M., Harispe, M., Henrissat, B., Hildén, K., Hope, R., Hossain, A., Karabika, E., Karaffa, L., Karányi, Z., Kraševec, N., Kuo, A., Kusch, H., LaButti, K., Lagendijk, E., Lapidus, A., Levasseur, A., Lindquist, E., Lipzen, A., Logrieco, A., MacCabe, A., Mäkelä, M., Malavazi, I., Melin, P., Meyer, V., Mielnichuk, N., Miskei, M., Molnár, Á., Mulé, G., Ngan, C., Orejas, M., Orosz, E., Ouedraogo, J., Overkamp, K., Park, H., Perrone, G., Piumi, F., Punt, P., Ram, A., Ramón, A., Rauscher, S., Record, E., Riaño-Pachón, D., Robert, V., Röhrig, J., Ruller, R., Salamov, A., Salih, N., Samson, R., Karaffa, E., Sanguinetti, M., Schütze, T., Sepčić, K., Shelest, E., Sherlock, G., Sophianopoulou, V., Squina, F., Sun, H., Susca, A., Todd, R., Tsang, A., Unkles, S., Wiele, N., Rossen-Uffink, D., Velasco de, C., Vesth, T., Visser, J., Yu, J., Zhou, M., Andersen, M., Archer, D., Baker, S., Benoit, I., Brakhage, A., Braus, G., Fischer, R., Frisvad, J., Goldman, G., Houbraken, J., Oakley, B., Pócsi, I., Scazzocchio, C., Seiboth, B., Kuyk, P., Wortman, J., Dyer, P., Grigoriev, I.: Comparative genomics reveals high biological diversity and specific adaptations in the industrially and medically important fungal genus Aspergillus.
Genome Biol. 18 (28), 1-45, 2017.

Miskei, M., Antal, C., Fuxreiter, M.: FuzDB: database of fuzzy complexes, a tool to develop stochastic structure-function relationships for protein complexes and higher-order assemblies.
Nucleic Acids Res. 45 D228-D235, 2017.

Miskei, M., Gregus, A., Sharma, R., Duró, N., Zsólyomi, F., Fuxreiter, M.: Fuzziness enables context dependence of protein interactions.
FEBS Lett. 591 (17), 2682-2695, 2017.

Bakti, F., Király, A., Orosz, E., Miskei, M., Emri, T., Leiter, É., Pócsi, I.: Study on the glutathione metabolism of the filamentous fungus.
Acta Microbiol. Immunol. Hung. 64 (3), 255-272, 2017.

Zhang, L., Zhou, Z., Guo, Q., Fokkens, L., Miskei, M., Pócsi, I., Zhang, W., Chen, M., Wang, L., Sun, Y., Donzelli, B., Gibson, D., Nelson, D., Luo, J., Rep, M., Liu, H., Yang, S., Wang, J., Krasnoff, S., Xu, Y., Molnár, I., Lin, M.: Insights into Adaptations to a Near- Obligate Nematode Endoparasitic Lifestyle from the Finished Genome of Drechmeria coniospora.
Sci Rep. 6 23122, 2016.

Leiter, É., Bálint, M., Miskei, M., Orosz, E., Szabó, Z., Pócsi, I.: Stress tolerances of nullmutants of function-unknown genes encoding menadione stress-responsive proteins in Aspergillus nidulans.
J. Basic Microbiol. 56 (7), 827-833, 2016.

Duró, N., Miskei, M., Fuxreiter, M.: Fuzziness endows viral motif-mimicry.
Mol. Biosyst. 11 (10), 2821-2829, 2015.

Sharma, R., Ráduly, Z., Miskei, M., Fuxreiter, M.: Fuzzy complexes: specific binding without complete folding.
FEBS Lett. 589 (19), 2533-2542, 2015.

Pócsi, I., Miskei, M., Xu, Y., Lin, M., Molnár, I.: Sequencing and annotation of the genome of the nematophagous fungus Drechmeria coniospora reveals the arsenal of an endoparasitoid fungus for the invasion of its host organisms.
Acta Microbiol. Immunol. Hung. 62 (Supplement-1), 200, 2015.

Nagygyörgy, E., Kovács, B., Leiter, É., Miskei, M., Pócsi, I., Hornok, L., Ádám, A.: Toxicity of abiotic stressors to Fusarium species: Differences in hydrogen peroxide and fungicide tolerance.
Acta Microbiol. Immunol. Hung. 61 (2), 189-208, 2014.

Karányi, Z., Holb, I., Hornok, L., Pócsi, I., Miskei, M.: FSRD: fungal stress response database.
Database. 2013 [6], 2013.

Szilágyi, M., Miskei, M., Karányi, Z., Lenkey, B., Pócsi, I., Emri, T.: Transcriptome changes initiated by carbon starvation in Aspergillus nidulans.
Microbiology (Reading, Engl.). 159 (1), 176-190, 2013.

Leiter, É., Gonzalez, A., Erdei, É., Casado, C., Kovács, L., Ádám, C., Oláh, J., Miskei, M., Molnár, M., Farkas, I., Hamari, Z., Ariño, J., Pócsi, I., Dombrádi, V.: Protein phosphatase Z modulates oxidative stress response in fungi.
Fungal Genet. Biol. 49 (9), 708-716, 2012.

Balla, Z., Oláh, J., Fári, M., Miskei, M.: A dohány kloroplaszt és nukleáris transzformációs technikák adaptálása a Debreceni Egyetemen.
In: I. Ag-Biotech Debrecen Konferencia / [ed. by Debreceni Egyetem AGTC MÉK Diószegi Sámuel Agrárinnovációs Intézet], Debreceni Egyetem AGTC MÉK Diószegi Sámuel Agrárinnovációs Intézet, Debrecen, 13, 2011.

Pusztahelyi, T., Klement, É., Szájli, E., Klem, J., Miskei, M., Karányi, Z., Emri, T., Kovács, S., Orosz, G., Kovács, K., Medzihradszky-Fölkl, K., Prade, R., Pócsi, I.: Comparison of transcriptional and translational changes caused by long-term menadione exposure in Aspergillus nidulans.
Fungal Genet. Biol. 48 (2), 92-103, 2011.

Miskei, M., Ádám, C., Kovács, L., Karányi, Z., Dombrádi, V.: Molecular Evolution of Phosphoprotein Phosphatases in Drosophila.
PLoS One. 6 (7), e22218, 2011.

Tóth, V., Nagy, C., Miskei, M., Pócsi, I., Emri, T.: Polyphasic characterization of "Aspergillus nidulans var. roseus" ATCC 58397.
Folia Microbiol. 56 (5), 381-388, 2011.

Oláh, J., Balla, Z., Fári, M., Miskei, M.: A dohány kloroplaszt és nukleáris transzformációs technikák adaptálása a Debreceni Egyetemen.
In: XVI. Növénynemesítési Tudományos Napok : Magyar Tudományos Akadémia Székháza, Budapest, 2010. március 11. : összefoglalók. Szerk.: Veisz Ottó, MTA Agrártudományok Osztályának Növénynemesítési Bizottsága, Budapest, , 2010.

Oláh, J., Balla, Z., Fári, M., Miskei, M.: A dohány kloroplaszt transzformációs technika adaptálása Magyarországon.
Agrártud. közl. 42 73-77, 2010.

Oláh, J., Balla, Z., Fári, M., Miskei, M.: Adopt tobacco plastid and nuclear transformation technics in the University of Debrecen.
In: IHC Lisboa 2010 Science and Horticulture for people : abstracts vol. 2, [s.n.], [s.l.], 284, 2010.

Balázs, A., Pócsi, I., Hamari, Z., Leiter, É., Emri, T., Miskei, M., Oláh, J., Tóth, V., Hegedűs, N., Prade, R., Molnár, M., Pócsi, I.: Atfa bZIP-type transcription factor regulates oxidative and osmotic stress responses in Aspergillus nidulans.
Mol. Genet. Genomics. 283 (3), 289-303, 2010.

Ádám, C., Henn, L., Miskei, M., Erdélyi, M., Friedrich, P., Dombrádi, V.: Conservation of male-specific expression of novel phosphoprotein phosphatases in Drosophila.
Dev. Genes Evol. 220 (3-4), 123-128, 2010.

Oláh, J., Balla, Z., Fári, M., Miskei, M.: Penicillium chrysogenum antifungális fehérje (PAF) termeltetése transzgénikus dohány (Nicotiana tabacum) növényben.
Agrártud. közl. 42 77-82, 2010.

Kovács, L., Farkas, I., Majoros, L., Miskei, M., Pócsi, I., Dombrádi, V.: The polymorphism of protein phosphatase Z1 gene in Candida albicans.
J. Basic Microbiol. 50 (Suppl.), S74-S82, 2010.

Miskei, M., Karányi, Z., Pócsi, I.: Annotation of stress-response proteins in the aspergilli.
Fungal Genet. Biol. 46 (1), 105-120, 2009.

Tóth, V., Antal, K., Gyémánt, G., Miskei, M., Pócsi, I., Emri, T.: Optimization of coprogen production in Neurospora crassa.
Acta Biol. Hung. 60 (3), 321-328, 2009.

Wortman, J., Gilsenan, J., Joardar, V., Deegan, J., Clutterbuck, J., Andersen, M., Archer, D., Bencina, M., Braus, G., Coutinho, P., Döhren, H., Doonan, J., Driessen, A., Durek, P., Espeso, E., Fekete, E., Flipphi, M., Estrada, C., Geysens, S., Goldman, G., Groot, P., Hansen, K., Harris, S., Heinekamp, T., Helmstaedt, K., Henrissat, B., Hofmann, G., Homan, T., Horio, T., Horiuchi, H., James, S., Jones, M., Karaffa, L., Karányi, Z., Kato, M., Keller, N., Kelly, D., Kiel, J., Kim, J., Klei, I., Klis, F., Kovalchuk, A., Kraševec, N., Kubicek, C., Liu, B., MacCabe, A., Meyer, V., Mirabito, P., Miskei, M., Mos, M., Mullins, J., Nelson, D., Nielsen, J., Oakley, B., Osmani, S., Pakula, T., Paszewski, A., Paulsen, I., Pilsyk, S., Pócsi, I., Punt, P., Ram, A., Ren, Q., Robellet, X., Robson, G., Seiboth, B., Solingen, P., Specht, T., Sun, J., Taheri-Talesh, N., Takeshita, N., Ussery, D., Kuyk, P., Visser, H., Vondervoort, P., De Vries, R., Walton, J., Xiang, X., Xiong, Y., Zeng, A., Brandt, B., Cornell, M., Hondely, C., Visser, J., Oliver, S., Turner, G.: The 2008 update of the Aspergillus nidulans genome annotation: A community effort.
Fungal Genet. Biol. 46 (1), 2-13, 2009.

Erdei, É., Pusztahelyi, T., Miskei, M., Barna, T., Pócsi, I.: Characterization and heterologous expression of an age dependent fungal/bacterial type chitinase of aspergillus nidulans.
Acta Microbiol. Immunol. Hung. 55 (3), 351-361, 2008.

Farkas, I., Dombrádi, V., Miskei, M., Szabados, L., Koncz, C.: Arabidopsis PPP family of serine/threonin phosphatases.
Trends Plant Sci. 12 (4), 169-176, 2007.

Pusztahelyi, T., Molnár, Z., Emri, T., Klement, É., Miskei, M., Kerékgyártó, J., Balla, J., Pócsi, I.: Comparative studies of differential expression of chitinolytic enzymes encoded by chiA, chiB, chiC and nagA genes in Aspergillus nidulans.
Folia Microbiol. 51 (6), 547-554, 2006.

Pócsi, I., Miskei, M., Karányi, Z., Emri, T., Ayoubi, P., Pusztahelyi, T., Balla, G., Prade, R.: Comparison of gene expression signatures of diamide, H2O2 and menadione exposed Aspergillus nidulans cultures - linking genome-wide transcriptional changes to cellular physiology.
BMC Genomics. 6 (182), 1-18, 2005.