Tudóstér: Proteomika Szolgáltató Laboratórium publikációi

Linkner, T., Ambrus, V., Kunkli, B., Szojka, Z., Kalló, G., Csősz, É., Kumar, A., Emri, M., Tőzsér, J., Mahdi, M.: Comparative Analysis of Differential Cellular Transcriptome and Proteome Regulation by HIV-1 and HIV-2 Pseudovirions in the Early Phase of Infection.
Int. J. Mol. Sci. 25 (1), 1-26, 2024.

Nokhoijav, E., Guba, A., Vadadokhau, U., Tőzsér, J., Győri, Z., Kalló, G., Csősz, É.: Comparative Analysis of Amino Acid and Biogenic Amine Compositions of Fermented Grape Beverages.
Metabolites. 13 (8), 1-13, 2023.

Vámos, A., Arianti, R., Vinnai, B., Alrifai, R., Shaw, A., Póliska, S., Guba, A., Csősz, É., Csomós, I., Mocsár, G., Lányi, C., Balajthy, Z., Fésüs, L., Kristóf, E.: Corrigendum: Human abdominal subcutaneous-derived active beige adipocytes carrying FTO rs1421085 obesity-risk alleles exert lower thermogenic capacity.
Front. Cell. Dev. Biol. 11 1-2, 2023.

Gellén, G., Klement, É., Biwott, K., Schlosser, G., Kalló, G., Csősz, É., Medzihradszky-Fölkl, K., Bacsó, Z.: Cross-Linking Mass Spectrometry on P-Glycoprotein.
Int. J. Mol. Sci. 24 (13), 1-24, 2023.

Vámos, A., Arianti, R., Vinnai, B., Alrifai, R., Shaw, A., Póliska, S., Guba, A., Csősz, É., Csomós, I., Mocsár, G., Lányi, C., Balajthy, Z., Fésüs, L., Kristóf, E.: Human Abdominal Subcutaneous-Derived Active Beige Adipocytes Carrying FTO rs1421085 Obesity-Risk Alleles Exert Lower Thermogenic Capacity.
Front. Cell. Dev. Biol. 11 1-18, 2023.

Martos, R., Tar, I., Nagy, A., Csősz, É., Kiss, C., Márton, I.: Hypercitrullination and anti-citrullinated protein antibodies in chronic apical periodontitis, a laboratory investigation. Does autoimmunity contribute to the pathogenesis?.
Int. Endod. J. 56 (5), 584-592, 2023.

Miltner, N., Kalló, G., Csősz, É., Miczi, M., Nagy, T., Mahdi, M., Mótyán, J., Tőzsér, J.: Identification of SARS-CoV-2 Main Protease (Mpro) Cleavage Sites Using Two-Dimensional Electrophoresis and In Silico Cleavage Site Prediction.
Int. J. Mol. Sci. 24 (4), 1-19, 2023.

Mittli, D., Tukacs, V., Ravasz, L., Csősz, É., Kozma, T., Kardos, J., Juhász, G., Kékesi, K.: LPS-induced acute neuroinflammation, involving interleukin-1 beta signaling, leads to proteomic, cellular, and network-level changes in the prefrontal cortex of mice.
Brain, Behavior, & Immunity - Health. 28 1-15, 2023.

Kalló, G., Bertalan, P., Márton, I., Kiss, C., Csősz, É.: Salivary Chemical Barrier Proteins in Oral Squamous Cell Carcinoma-Alterations in the Defense Mechanism of the Oral Cavity.
Int. J. Mol. Sci. 24 (17), 1-20, 2023.

Bodnár, M., Fazekas, E., Nagy, T., Miltner, N., Kalló, G., Kerekes, K., Prépost, E., Mótyán, J.: Synthesis of Galacto-oligosaccharides in Milk by Using Bifidobacterium bifidum β-galactosidases (Saphera 2600L and Nola Fit 5500) Immobilized on Chitosan Beads.
Food Bioprocess Technol. [Epub ahead of print]2023.

Kalló, G., Kumar, A., Tőzsér, J., Csősz, É.: Chemical Barrier Proteins in Human Body Fluids.
Biomedicines. 10 (7), 1-26, 2022.

Laczik, M., Erdős, E., Ozgyin, L., Hevessy, Z., Csősz, É., Kalló, G., Nagy, T., Barta, E., Póliska, S., Szatmári, I., Bálint, B.: Extensive proteome and functional genomic profiling of variability between genetically identical human B-lymphoblastoid cells.
Sci Data. 9 (1), 1-12, 2022.

Guba, A., Bába, O., Tőzsér, J., Csősz, É., Kalló, G.: Fast and Sensitive Quantification of AccQ-Tag Derivatized Amino Acids and Biogenic Amines by UHPLC-UV Analysis from Complex Biological Samples.
Metabolites. 12 (3), 272, 2022.

Nokhoijav, E., Guba, A., Kumar, A., Kunkli, B., Kalló, G., Káplár, M., Somodi, S., Garai, I., Csutak, A., Tóth, N., Emri, M., Tőzsér, J., Csősz, É.: Metabolomic Analysis of Serum and Tear Samples from Patients with Obesity and Type 2 Diabetes Mellitus.
Int. J. Mol. Sci. 23 1-19, 2022.

Arianti, R., Vinnai, B., Bartáné Tóth, B., Shaw, A., Csősz, É., Vámos, A., Győry, F., Fischer-Posovszky, P., Wabitsch, M., Kristóf, E., Fésüs, L.: ASC-1 transporter-dependent amino acid uptake is required for the efficient thermogenic response of human adipocytes to adrenergic stimulation.
FEBS Lett. 595 (16), 2085-2098, 2021.

Linkner, T., Ambrus, V., Kunkli, B., Szojka, Z., Kalló, G., Csősz, É., Kumar, A., Emri, M., Tőzsér, J., Mahdi, M.: Cellular Proteo-Transcriptomic Changes in the Immediate Early-Phase of Lentiviral Transduction.
Microorganisms. 9 (11), 1-21, 2021.

Pethő, D., Hendrik, Z., Nagy, A., Beke, L., Patsalos, A., Nagy, L., Póliska, S., Méhes, G., Tóth, C., Potor, L., Eaton, J., Jacob, H., Balla, G., Balla, J., Gáll, T.: Heme cytotoxicity is the consequence of endoplasmic reticulum stress in atherosclerotic plaque progression.
Sci. Rep. 11 (1), 2021.

Potor, L., Hendrik, Z., Patsalos, A., Katona, É., Méhes, G., Póliska, S., Csősz, É., Kalló, G., Komáromi, I., Combi, Z., Posta, N., Sikura, K., Pethő, D., Oros, M., Vereb, G., Tóth, C., Gergely, P., Nagy, L., Balla, G., Balla, J.: Oxidation of hemoglobin drives a proatherogenic polarization of macrophages in human atherosclerosis.
Antioxid. Redox Signal. 35 (12), 917-950, 2021.

Kalló, G., Varga, A., Szabó, J., Emri, M., Tőzsér, J., Csutak, A., Csősz, É.: Reduced Level of Tear Antimicrobial and Immunomodulatory Proteins as a Possible Reason for Higher Ocular Infections in Diabetic Patients.
Pathogens. 10 (7), 1-14, 2021.

Borbély, A., Pethő, L., Szabó, I., Al-Majidi, M., Steckel, A., Nagy, T., Kéki, S., Kalló, G., Csősz, É., Mező, G., Schlosser, G.: Structural Characterization of Daunomycin-Peptide Conjugates by Various Tandem Mass Spectrometric Techniques.
Int. J. Mol. Sci. 22 (4), 1-15, 2021.

Révész, Á., Milley, M., Nagy, K., Szabó, D., Kalló, G., Csősz, É., Vékey, K., Drahos, L.: Tailoring to Search Engines: bottom-Up Proteomics with Collision Energies Optimized for Identification Confidence.
J. Proteome Res. 20 (1), 474-484, 2021.

Kalló, G., Kunkli, B., Győri, Z., Szilvássy, Z., Csősz, É., Tőzsér, J.: Compounds with Antiviral, Anti-Inflammatory and Anticancer Activity Identified in Wine from Hungary's Tokaj Region via High Resolution Mass Spectrometry and Bioinformatics Analyses.
Int. J. Mol. Sci. 21 (24), 1-20, 2020.

Scholtz, B., Vo Minh, D., Kiss, C., Tar, I., Kumar, A., Tőzsér, J., Csősz, É., Márton, I.: Examination of Oral Squamous Cell Carcinoma and Precancerous Lesions Using Proximity Extension Assay and Salivary RNA Quantification.
Biomedicines. 8 (12), 1-16, 2020.

Alvarado, G., Tóth, A., Csősz, É., Kalló, G., Dankó, K., Csernátony, Z., Smith, A., Gram, M., Akerström, B., Édes, I., Balla, G., Papp, Z., Balla, J.: Heme-Induced Oxidation of Cysteine Groups of Myofilament Proteins Leads to Contractile Dysfunction of Permeabilized Human Skeletal Muscle Fibres.
Int. J. Mol. Sci. 21 (21), 1-17, 2020.

Steckel, A., Uray, K., Kalló, G., Csősz, É., Schlosser, G.: Investigation of Neutral Losses and the Citrulline Effect for Modified H4 N-Terminal Pentapeptides.
J. Am. Soc. Mass Spectrom. 31 (3), 565-573, 2020.

Csősz, É., Tóth, F., Mahdi, M., Tsaprailis, G., Emri, M., Tőzsér, J.: Analysis of networks of host proteins in the early time points following HIV transduction.
BMC Bioinformatics. 20 1-18, 2019.

Csősz, É., Márkus, B., Darula, Z., Medzihradszky-Fölkl, K., Nemes, J., Szabó, E., Tőzsér, J., Kiss, C., Márton, I.: Salivary proteome profiling of oral squamous cell carcinoma in a Hungarian population.
FEBS Open Bio. 8 (4), 556-569, 2018.

Csősz, É., Tóth, N., Deák, E., Csutak, A., Tőzsér, J.: Wound-Healing Markers Revealed by Proximity Extension Assay in Tears of Patients following Glaucoma Surgery.
Int. J. Mol. Sci. 19 (12), 1-19, 2018.

Márkus, B., Kristóf, E., Csomós, I., Fésüs, L., Csősz, É.: Analysis of the protein crosslink-profile changes and the neutrophil extracellular trap patterns elicited by different stimuli.
In: Transglutaminases in Medicine, Debreceni Egyetemi Kiadó, Debrecen, 83, (2017).

Kecskeméti, Á., Bakó, J., Csarnovics, I., Csősz, É., Gáspár, A.: Development of an enzymatic reactor applying spontaneously adsorbed trypsin on the surface of a PDMS microfluidic device.
Anal. Bioanal. Chem. 409 (14), 3573-3585, 2017.

Csősz, É., Deák, E., Kalló, G., Csutak, A., Tőzsér, J.: Diabetic retinopathy: proteomic approaches to help the differential diagnosis and to understand the underlying molecular mechanisms.
J. Proteomics. 150 351-358, 2017.

Virga, J., Szemcsák, C., Reményi-Puskár, J., Tóth, J., Hortobágyi, T., Csősz, É., Zahuczky, G., Szivos, L., Bognár, L., Klekner, Á.: Differences in Extracellular Matrix Composition and its Role in Invasion in Primary and Secondary Intracerebral Malignancies.
Anticancer Res. 37 (8), 4119-4126, 2017.

Márkus, B., Szabó, K., Tőzsér, J., Csősz, É., Dombrádi, V.: Proteomic analysis of protein phosphatase Z1 functions in Candida albicans.
In: Hungarian Molecular Life Sciences, [s.n.], Eger, 159, (2017).

Csősz, É., Kalló, G., Márkus, B., Deák, E., Csutak, A., Tőzsér, J.: Quantitative body fluid proteomics in medicine: a focus on minimal invasiveness.
J. Proteomics. 153 30-43, 2017.

Kecskeméti, Á., Nagy, C., Csősz, É., Kalló, G., Gáspár, A.: The application of a microfluidic reactor including spontaneously adsorbed trypsin for rapid protein digestion of human tear samples.
Proteom. Clin. Appl. 11 (11-12), 1-9, 2017.

Márkus, B., Pató, Z., Sarang, Z., Albert, R., Tőzsér, J., Petrovski, G., Csősz, É.: The proteomic profile of a mouse model of proliferative vitreoretinopathy.
FEBS Open Bio. 7 (8), 1166-1177, 2017.

Székely, T., Márkus, B., Csősz, É., Fésüs, L.: Update to TRANSDAB: a collection of transglutaminase substrates and interaction partners.
In: Transglutaminases in Medicine, Debreceni Egyetemi Kiadó, Debrecen, 83, (2017).

Deák, E., Csősz, É., Csutak, A.: Alterations in corneal parameters and protein profile in tears of type 1 diabetes mellitus patients.
Biokémia. 40 (3), 43, 2016.

Deák, E., Kalló, G., Márkus, B., Szalai, E., Csősz, É., Csutak, A.: Alterations of tear proteins in patients with type 1 diabetes mellitus.
In: 10th Central and Eastern European Proteomic Conference. Szerk.: Vékey Károly, Research Centre for Natural Sciences of the Hungarian Academy of Sciences, Budapest, 143, 2016.

Márkus, B., Csősz, É., Tőzsér, J., Emri, M., Szabó, A., Redl, P., Tar, I., Kövér, Z., Olasz, L., Molnár, G., Piffkó, J., Barabás, P., Barabás, J., Márton, I.: A magyar populációban alkalmazható szájüregi laphámrák-specifikus nyál biomarkerek azonosítása tömegspektrometriás és immunológiai módszerek segítségével.
In: A Magyar Fogorvosok Egyesületének Árkövy Vándorgyűlése: Perspektívák a paro-implantológában és a komprehenzív fogászatban, Szegedi Egyetem Fogorvostudományi Kar, Szeged, 66, (2016).

Deák, E., Kalló, G., Márkus, B., Szalai, E., Csutak, A., Csősz, É.: Az in vivo konfokális cornea mikrószkópia és a könnyproteomikai vizsgálatok kombinációjának jelentősége 1-es típusú cukorbetegségben.
In: Omikai Fórum, MTA DAB Genomika és Proteomika Munkabizottság, Debrecen, 6, 2016.

Kalló, G., Emri, M., Varga, Z., Ujhelyi, B., Tőzsér, J., Csutak, A., Csősz, É.: Changes in the chemical barrier composition of tears in Alzheimer's disease reveal potential tear diagnostic biomarkers.
PLoS One. 11 (6), 1-14, 2016.

Szalai, E., Deák, E., Módis, L., Németh, G., Berta, A., Nagy, A., Felszeghy, E., Káposzta, R., Malik, R., Csutak, A.: Early Corneal Cellular and Nerve Fibre Pathology in Young patients with Type 1 Diabetes Mellitus Identified using Corneal Confocal Microscopy.
In: 9th Molecular, Cell and Immune Biology Winter Symposium. Szerk.: Mádi András, Debreceni Egyetemi Kiadó, Debrecen, 16, 2016.

Márkus, B., Csősz, É., Tőzsér, J., Emri, M., Szabó, A., Redl, P., Tar, I., Kövér, Z., Olasz, L., Molnár, G., Piffkó, J., Barabás, P., Barabás, J., Márton, I.: Fehérje alapú szájüregi laphámrák (OSCC) biomarkerek azonosítása az Észak-Alföldi régióban gyűjtött nyálmintákból.
In: 17. Debreceni Fogászati Napok, Debreceni Egyetem Fogorvostudományi Kar, Debrecen, 98, 2016.

Márkus, B., Csősz, É., Emri, M., Kalló, G., Márton, I.: Investigation of OSCC-specific salivary biomarkers in Hungarian population using targeted proteomics and immunological methods.
In: Oral Health Inequalities in Europe, European Association of Dental Public Health, Budapest, 90-91, 2016.

Márkus, B., Kalló, G., Lábiscsák, P., Emri, M., Fera, M., Tar, I., Csősz, É., Márton, I.: Proteomics investigation of OSCC-specific salivary biomarkers in Hungarian population.
In: 10th Central and Eastern European Proteomic Conference Book of Abstracts and Program, Magyar Tudományos Akadémia, Budapest, 1, 2016.

Márkus, B., Emri, M., Klekner, Á., Csősz, É.: Selected Reaction Monitoring (SRM)-based targeted proteomics method development for brain protein analysis.
In: 9th Molecular Cell and Immune Biology Winter Symposium, Debreceni Egyetem, Debrecen, 8, 2016.

Márkus, B., Lábiscsák, P., Kalló, G., Emri, M., Csősz, É., Márton, I.: Szájüregi laphámrák (OSCC) - specifikus biomarkerek azonosítása tömegspektrometriás és immunológiai módszerek segítségével a magyar populációban gyűjtött nyálmintákból.
In: Omikai Fórum, MTA DAB Genomika és Proteomika Munkabizottság, Debrecen, 1, 2016.

Deák, E., Csősz, É., Csutak, A.: Alterations in ophthalmological parameters and cytokine levels in tears of patients with glaucoma.
In: Molecules of Life FEBS3+ Meeting. Ed.: Janko Kos, Natasa Poklar Ulrih, Slovenian Biochemical Society, Slovenia, 247, 2015. ISBN: 9789619387900

Márkus, B., Kristóf, E., Csomós, K., Fésüs, L., Csősz, É.: Analysis of changes in neutrophil extracellular trap (NET) proteins profile using proteomic methods.
In: FEBS3+ Meeting Molecules of life, Slovenian Biochemical Society, Slovenia, 211, 2015.

Márkus, B., Kristóf, E., Csomós, K., Fésüs, L., Csősz, É.: Analysis of the protein crosslink-profile changes during neutrophil extracellular trap formation.
In: 33rd Informal Meeting on Mass Spectrometry

Márkus, B., Kristóf, E., Csomós, K., Fésüs, L., Csősz, É.: Analysis of the protein crosslink profile during Neutrophil Extracellular Trap formation.
In: 8th Molecular Cell and Immune Biology Winter Symposium, Debreceni Egyetem, Debrecen, 8, 2015.

Török, Z., Pető, T., Csősz, É., Tukacs, E., Molnár, Á., Berta, A., Tőzsér, J., Hajdu, A., Nagy, V., Domokos, B., Csutak, A.: Combined Methods for Diabetic Retinopathy Screening, Using Retina Photographs and Tear Fluid Proteomics Biomarkers.
J. Diabetes Res. 2015 1-8, 2015.

Csősz, É., Emri, G., Kalló, G., Tsaprailis, G., Tőzsér, J.: Highly abundant defense proteins in human sweat as revealed by targeted proteomics and label-free quantification mass spectrometry.
J. Eur. Acad. Dermatol. Venereol. 29 (10), 2024-2031, 2015.

Kalló, G., Chatterjee, A., Tóth, M., Rajnavölgyi, É., Csutak, A., Tőzsér, J., Csősz, É.: Relative quantification of human [béta]-defensins by a proteomics approach based on selected reaction monitoring.
Rapid Commun. Mass Spectrom. 29 (18), 1623-1631, 2015.

Márkus, B., Perényi, K., Tőzsér, J., Csősz, É., Dombrádi, V.: Revealing the functions of protein phosphatase Z1 in Candida albicans with proteomic methods.
In: Hungarian Molecular Life Sciences 2015

Márkus, B., Kristóf, E., Csomós, K., Fésüs, L., Csősz, É.: Analysis of crosslinked protein sin neutrophil extracellular trap.
In: 32nd IMMS 2014, s.n., Balatonszárszó, 147, 2014.

Márkus, B., Pató, Z., Albert, R., Sarang, Z., Petrovski, G., Csősz, É.: A proliferatív vitreoretinopátiás (PVR) elváltozásra jellemző fehérje mintázatok tanulmányozása egér üvegtesti mintákban.
In: Az ér- és kardiovaszkuláris betegségek patomechanizmusai, diagnosztikái, farmakológiai befolyásolhatóságuk az alapkutatás szintjén / [kiad. az MTA], Magyar Tudományos Akadémia, Debrecen, , 2014.

Deák, E., Csutak, A., Tőzsér, J., Csősz, É.: Citrullináció - mint lehetséges biomarker cukorbetegek és Alzheimer-kórosak könnymintáiban.
In: XIX. Bolyai Konferencia, [s.n.], Budapest, 28, 2014.

Deák, E.: Fehérje citrullináció vizsgálata citrullin ellenes antitest segítségével.
In: Debreceni Egyetem Orvos- és Egészségtudományi Centrum TDK Konferencia. Szerk.: Erdődi Ferenc, Gáál Zsuzsanna, Bereczky Zsuzsanna, Szentandrássy Norbert, Borbásné Sebestyén Veronika, Debreceni Egyetemi Kiadó, Debrecen, 267, 2014.

Deák, E., Csutak, A., Lábiscsák, P., Tőzsér, J., Csősz, É.: Könnyfehérjék citrullinációjának vizsgálata diabeteses és Alzheimer kóros betegekben.
In: Az ér- és kardiovaszkuláris betegségek patomechanizmusai, diagnosztikái, farmakológiai befolyásolhatóságuk az alapkutatás szintjén, MTA Debreceni Akadémiai Bizottság, Debrecen, 38, 2014.

Márkus, B., Kristóf, E., Csomós, K., Fésüs, L., Csősz, É.: The effect of different treatments ont he characteristic of crosslinked proteins in Neutrophil Extracellular Trap.
Biokémia. 38 (3), 67, 2014.

Veréb, Z., Albert, R., Póliska, S., Olstad, O., Akhtar, S., Moe, M., Petrovski, G.: Comparison of upstream regulators in human ex vivo cultured cornea limbal epithelial stem cells and differentiated corneal epithelial cells.
BMC Genomics. 14 (1), [1-33], 2013.

Csősz, É., Boross, P., Csutak, A., Berta, A., Tóth, F., Póliska, S., Török, Z., Tőzsér, J.: Quantitative analysis of proteins in the tear fluid of patients with diabetic retinopathy.
Journal of Proteomics. 75 (7), 2196-2204, 2012.

Emri, T., Csősz, É., Tőzsér, J.: Fehérjebiotechnológia.
Digitális Tankönyvtár, Debrecen, 124 p., 2011.

Aradi, J., Balajthy, Z., Csősz, É., Scholtz, B., Szatmári, I., Tőzsér, J., Varga, T.: Molecular therapies.
University of Debrecen, Debrecen, 120 p., 2011.

Aradi, J., Balajthy, Z., Csősz, É., Scholtz, B., Szatmári, I., Tőzsér, J., Varga, T.: Molekuláris terápiák.
Debreceni Egyetem, Debrecen, 112 p., 2011.

Emri, T., Csősz, É., Tőzsér, J.: Protein Biotechnology.
University of Debrecen, Debrecen, 124 p., 2011.

Csutak, A., Silver, D., Sperka, T., Kádas, J., Vereb, G., Berta, A., Tőzsér, J.: Urokinase down-regulation by aprotinin after photorefractive keratectomy in rabbit corneal epithelial cells.
Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 45 1415, 2004.