Nagy Gergely

Név: Nagy Gergely

Szakterület: molekuláris biológus

Teljes publikációs lista

A lista áttöltése az MTMT rendszerébe
Hiányzó közlemények feltöltése
Hitelesített Publikációs Lista igénylése
OA letöltési statisztika megtekintése

Feltöltött közlemény:

DEA-ban:

OA:

Publikációs időszak:

2010-2024

2024

Nagy, G., Bojcsuk, D., Tzerpos, P., Silye-Cseh, T., Nagy, L.: Lineage-determining transcription factor-driven promoters regulate cell type-specific macrophage gene expression.
Nucleic Acids Res. [Epub ahead of print]2024.

Folyóirat-mutatók:

D1 Genetics (2023)

2023

Domokos, A., Varga, Z., Jambrovics, K., Caballero-Sánchez, N., Szabó, E., Nagy, G., Scholtz, B., Halász, L., Váradi, E., Bene, K., Türk-Mázló, A., Bácsi, A., Jeney, V., Szebeni, G., Nagy, L., Czimmerer, Z.: The transcriptional control of the VEGFA-VEGFR1 (FLT1) axis in alternatively polarized murine and human macrophages.
Front. Immunol. 14 1-20, 2023.

Folyóirat-mutatók:

Q1 Immunology
Q1 Immunology and Allergy

2022

Patsalos, A., Halász, L., Medina-Serpas, M., Berger, W., Dániel, B., Tzerpos, P., Kiss, M., Nagy, G., Fischer, C., Simándi, Z., Varga, T., Nagy, L.: A growth factor-expressing macrophage subpopulation orchestrates regenerative inflammation via GDF-15.
J. Exp. Med. 219 (1), 1-38, 2022.

Folyóirat-mutatók:

D1 Immunology
D1 Immunology and Allergy
D1 Medicine (miscellaneous)
Göczi, L., Csumita, M., Horváth, A., Nagy, G., Póliska, S., Pigni, M., Thelemann, C., Dániel, B., Mianesaz, H., Varga, T., Sen, K., Raghav, S., Schoggins, J., Nagy, L., Acha-Orbea, H., Meissner, F., Reith, W., Széles, L.: A Multi-Omics Approach Reveals Features That Permit Robust and Widespread Regulation of IFN-Inducible Antiviral Effectors.
J. Immun. 209 (10), 1930-1941, 2022.

Folyóirat-mutatók:

Q1 Immunology
Q1 Immunology and Allergy

2020

Fadel, L., Rehó, B., Volkó, J., Bojcsuk, D., Kolostyák, Z., Nagy, G., Müller, G., Simándi, Z., Hegedűs, É., Szabó, G., Tóth, K., Nagy, L., Vámosi, G.: Agonist binding directs dynamic competition among nuclear receptors for heterodimerization with retinoid X receptor.
J. Biol. Chem. 295 (29), 10045-10061, 2020.

Folyóirat-mutatók:

D1 Biochemistry
Q1 Cell Biology
Q1 Molecular Biology
Bojcsuk, D., Nagy, G., Bálint, B.: Alternatively Constructed Estrogen Receptor Alpha-Driven Super-Enhancers Result in Similar Gene Expression in Breast and Endometrial Cell Lines.
Int. J. Mol. Sci. 21 1-18, 2020.

Folyóirat-mutatók:

Q2 Catalysis
D1 Computer Science Applications
D1 Inorganic Chemistry
Q1 Medicine (miscellaneous)
Q2 Molecular Biology
D1 Organic Chemistry
D1 Physical and Theoretical Chemistry
D1 Spectroscopy
Nagy, G., Nagy, L.: Motif grammar: the basis of the language of gene expression.
Computational and Structural Biotechnology Journal. 18 2026-2032, 2020.

Folyóirat-mutatók:

Q1 Biochemistry
D1 Biophysics
D1 Biotechnology
D1 Computer Science Applications
Q1 Genetics
Q2 Structural Biology
Csumita, M., Csermely, A., Horváth, A., Nagy, G., Monori, F., Göczi, L., Orbea, H., Reith, W., Széles, L.: Specific enhancer selection by IRF3, IRF5 and IRF9 is determined by ISRE half-sites, 5' and 3' flanking bases, collaborating transcription factors and the chromatin environment in a combinatorial fashion.
Nucleic Acids Res. 48 (2), 589-604, 2020.

Folyóirat-mutatók:

D1 Genetics
Dániel, B., Czimmerer, Z., Halász, L., Botó, P., Kolostyák, Z., Póliska, S., Berger, W., Tzerpos, P., Nagy, G., Horváth, A., Hajas, G., Silye-Cseh, T., Nagy, A., Sauer, S., Francois-Deleuze, J., Szatmári, I., Bácsi, A., Nagy, L.: The transcription factor EGR2 is the molecular linchpin connecting STAT6 activation to the late, stable epigenomic program of alternative macrophage polarization.
Genes Dev. 34 (21-22), 1474-1492, 2020.

Folyóirat-mutatók:

D1 Developmental Biology
D1 Genetics
Nagy, G., Dániel, B., Cuaranta-Monroy, I., Nagy, L.: Unraveling the Hierarchy of cis and trans Factors That Determine the DNA Binding by Peroxisome Proliferator-Activated Receptor γ.
Mol. Cell. Biol. 40 (7), 1-20, 2020.

Folyóirat-mutatók:

Q1 Cell Biology
Q1 Molecular Biology

2019

Patsalos, A., Tzerpos, P., Halász, L., Nagy, G., Pap, A., Giannakis, N., Lyroni, K., Koliaraki, V., Pintye, É., Dezső, B., Kollias, G., Spilianakis, C., Nagy, L.: The BACH1-HMOX1 Regulatory Axis Is Indispensable for Proper Macrophage Subtype Specification and Skeletal Muscle Regeneration.
J. Immunol. 203 (6), 1532-1547, 2019.

Folyóirat-mutatók:

Q1 Immunology
Q1 Immunology and Allergy

2018

Czimmerer, Z., Horváth, A., Dániel, B., Nagy, G., Cuaranta-Monroy, I., Kiss, M., Kolostyák, Z., Póliska, S., Steiner, L., Giannakis, N., Varga, T., Nagy, L.: Dynamic transcriptional control of macrophage miRNA signature via inflammation responsive enhancers revealed using a combination of next generation sequencing-based approaches.
Biochim. Biophys. Acta. Gene Regul. Mech. 1861 (1), 14-28, 2018.

Folyóirat-mutatók:

D1 Biochemistry
D1 Biophysics
Q1 Genetics
Q1 Molecular Biology
Q1 Structural Biology
Czimmerer, Z., Nagy, Z., Nagy, G., Horváth, A., Silye-Cseh, T., Kriston, Á., Jonás, D., Sauer, S., Steiner, L., Dániel, B., Deleuze, J., Nagy, L.: Extensive and functional overlap of the STAT6 and RXR cistromes in the active enhancer repertoire of human CD14+ monocyte derived differentiating macrophages.
Mol. Cell. Endocrinol. 471 63-74, 2018.

Folyóirat-mutatók:

Q1 Biochemistry
Q1 Endocrinology
Q2 Molecular Biology
Dániel, B., Nagy, G., Horváth, A., Czimmerer, Z., Cuaranta-Monroy, I., Póliska, S., Hays, T., Sauer, S., Francois-Deleuze, J., Nagy, L.: The IL-4/STAT6/PPAR[gamma] signaling axis is driving the expansion of the RXR heterodimer cistrome, providing complex ligand responsiveness in macrophages.
Nucleic Acids Res. 46 (9), 4425-4439, 2018.

Folyóirat-mutatók:

D1 Genetics
Dániel, B., Nagy, G., Czimmerer, Z., Horváth, A., Hammers, D., Cuaranta-Monroy, I., Póliska, S., Tzerpos, P., Kolostyák, Z., Hays, T., Patsalos, A., Houtman, R., Sauer, S., Francois-Deleuze, J., Rastinejad, F., Bálint, B., Sweeney, H., Nagy, L.: The Nuclear Receptor PPAR[gamma] Controls Progressive Macrophage Polarization as a Ligand-Insensitive Epigenomic Ratchet of Transcriptional Memory.
Immunity. 49 (4), 615-626, 2018.

Folyóirat-mutatók:

D1 Immunology
D1 Immunology and Allergy
D1 Infectious Diseases
Czimmerer, Z., Dániel, B., Horváth, A., Rückerl, D., Nagy, G., Kiss, M., Peloquin, M., Budai, M., Cuaranta-Monroy, I., Simándi, Z., Steiner, L., Nagy, B., Póliska, S., Bankó, C., Bacsó, Z., Schulman, I., Sauer, S., Deleuze, J., Allen, J., Benkő, S., Nagy, L.: The Transcription Factor STAT6 Mediates Direct Repression of Inflammatory Enhancers and Limits Activation of Alternatively Polarized Macrophages.
Immunity. 48 (1), 75-90, 2018.

Folyóirat-mutatók:

D1 Immunology
D1 Immunology and Allergy
D1 Infectious Diseases

2017

Bojcsuk, D., Nagy, G., Bálint, B.: Inducible super-enhancers are organized based on canonical signal-specific transcription factor binding elements.
Nucleic Acids Res. 45 (7), 3693-3706, 2017.

Folyóirat-mutatók:

D1 Genetics
Kiss, M., Czimmerer, Z., Nagy, G., Bieniasz-Krzywiec, P., Ehling, M., Pap, A., Póliska, S., Botó, P., Tzerpos, P., Horváth, A., Kolostyák, Z., Dániel, B., Szatmári, I., Mazzone, M., Nagy, L.: Retinoid X receptor suppresses a metastasis-promoting transcriptional program in myeloid cells via a ligand-insensitive mechanism.
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 114 (40), 10725-10730, 2017.

Folyóirat-mutatók:

D1 Multidisciplinary

2016

Varga, T., Mounier, R., Patsalos, A., Gogolák, P., Peloquin, M., Horváth, A., Pap, A., Dániel, B., Nagy, G., Pintye, É., Póliska, S., Cuvellier, S., Ben Larbi, S., Sansbury, B., Spite, M., Brown, C., Chazaud, B., Nagy, L.: Macrophage PPAR[gamma], a Lipid Activated Transcription Factor Controls the Growth Factor GDF3 and Skeletal Muscle Regeneration.
Immunity. 45 (5), 1038-1051, 2016.

Folyóirat-mutatók:

D1 Immunology
D1 Immunology and Allergy
D1 Infectious Diseases
Nagy, G., Czipa, E., Steiner, L., Nagy, T., Pongor, S., Nagy, L., Barta, E.: Motif oriented high-resolution analysis of ChIP-seq data reveals the topological order of CTCF and cohesin proteins on DNA.
BMC Genomics. 17 (637), 1-9, 2016.

Folyóirat-mutatók:

D1 Biotechnology
Q1 Genetics
Czimmerer, Z., Varga, T., Kiss, M., Vázquez, C., Doan-Xuan, Q., Rückerl, D., Tattikota, S., Yan, X., Nagy, Z., Dániel, B., Póliska, S., Horváth, A., Nagy, G., Varallyay, É., Poy, M., Allen, J., Bacsó, Z., Abreu-Goodger, C., Nagy, L.: The IL-4/STAT6 signaling axis establishes a conserved microRNA signature in human and mouse macrophages regulating cell survival via miR-342-3p.
Genome Med. 8 (1), 1-22, 2016.

Folyóirat-mutatók:

D1 Genetics
D1 Genetics (clinical)
D1 Molecular Biology
D1 Molecular Medicine

2014

Cuaranta-Monroy, I., Simándi, Z., Kolostyák, Z., Doan-Xuan, Q., Póliska, S., Horváth, A., Nagy, G., Bacsó, Z., Nagy, L.: Highly efficient differentiation of embryonic stem cells into adipocytes by ascorbic acid.
Stem Cell Res. 13 (1), 88-97, 2014.

Folyóirat-mutatók:

Q2 Cell Biology
Q2 Developmental Biology
D1 Medicine (miscellaneous)
Dániel, B., Nagy, G., Hah, N., Horváth, A., Czimmerer, Z., Póliska, S., Gyuris, T., Keirsse, J., Gysemans, C., Van Ginderachter, J., Bálint, B., Evans, R., Barta, E., Nagy, L.: The active enhancer network operated by liganded RXR supports angiogenic activity in macrophages.
Genes Dev. 28 (14), 1562-1577, 2014.

Folyóirat-mutatók:

D1 Developmental Biology
D1 Genetics
Dániel, B., Nagy, G., Nagy, L.: The intriguing complexities of mammalian gene regulation: how to link enhancers to regulated genes. Are we there yet?.
FEBS Lett. 588 (15), 2379-2391, 2014.

Folyóirat-mutatók:

Q1 Biochemistry
D1 Biophysics
Q2 Cell Biology
Q1 Genetics
Q2 Molecular Biology
Q2 Structural Biology

2013

Nagy, G., Dániel, B., Jonás, D., Nagy, L., Barta, E.: A novel method to predict regulatory regions based on histone mark landscapes in macrophages.
Immunobiology. 218 (11), 1416-1427, 2013.

Folyóirat-mutatók:

Q1 Hematology
Q2 Immunology
Q1 Immunology and Allergy

Mindet mutasd

frissítve: 2024-11-10, 01:29

Jelenlegi hely

Nagy Gergely

Nagy Gergely

Teljes publikációs lista

Tudományos folyóiratcikkek
SCImago besorolása

SCImago kategóriák

Közlemények megoszlása
műfaj szerint

Közlemények megoszlása
évszám szerint

Közlemények megoszlása
nyelv szerint

Közlemények megoszlása
folyóiratok szerint

iDEa társszerzők

Egyéb társszerzők

Jelenlegi hely

Nagy Gergely

Nagy Gergely

Teljes publikációs lista

Tudományos folyóiratcikkekSCImago besorolása

SCImago kategóriák

Közlemények megoszlásaműfaj szerint

Közlemények megoszlásaévszám szerint

Közlemények megoszlásanyelv szerint

Közlemények megoszlásafolyóiratok szerint

iDEa társszerzők

Egyéb társszerzők

Tudományos folyóiratcikkek
SCImago besorolása

Közlemények megoszlása
műfaj szerint

Közlemények megoszlása
évszám szerint

Közlemények megoszlása
nyelv szerint

Közlemények megoszlása
folyóiratok szerint