Jelenlegi hely

Nagy Gergely

Nagy Gergely

Nagy Gergely
Név: Nagy Gergely
Szakterület: molekuláris biológus

Teljes publikációs lista

A lista áttöltése az MTMT rendszerébe
Hiányzó közlemények feltöltése
Hitelesített Publikációs Lista igénylése
OA letöltési statisztika megtekintése
Feltöltött közlemény:
26
DEA-ban:
26
OA:
17
Publikációs időszak:
2010-2024
2024
  1. Nagy, G., Bojcsuk, D., Tzerpos, P., Silye-Cseh, T., Nagy, L.: Lineage-determining transcription factor-driven promoters regulate cell type-specific macrophage gene expression.
    Nucleic Acids Res. [Epub ahead of print]2024.
    Folyóirat-mutatók:
    D1 Genetics (2023)
2023
2022
  1. Patsalos, A., Halász, L., Medina-Serpas, M., Berger, W., Dániel, B., Tzerpos, P., Kiss, M., Nagy, G., Fischer, C., Simándi, Z., Varga, T., Nagy, L.: A growth factor-expressing macrophage subpopulation orchestrates regenerative inflammation via GDF-15.
    J. Exp. Med. 219 (1), 1-38, 2022.
    Folyóirat-mutatók:
    D1 Immunology
    D1 Immunology and Allergy
    D1 Medicine (miscellaneous)
  2. Göczi, L., Csumita, M., Horváth, A., Nagy, G., Póliska, S., Pigni, M., Thelemann, C., Dániel, B., Mianesaz, H., Varga, T., Sen, K., Raghav, S., Schoggins, J., Nagy, L., Acha-Orbea, H., Meissner, F., Reith, W., Széles, L.: A Multi-Omics Approach Reveals Features That Permit Robust and Widespread Regulation of IFN-Inducible Antiviral Effectors.
    J. Immun. 209 (10), 1930-1941, 2022.
    Folyóirat-mutatók:
    Q1 Immunology
    Q1 Immunology and Allergy
2020
  1. Fadel, L., Rehó, B., Volkó, J., Bojcsuk, D., Kolostyák, Z., Nagy, G., Müller, G., Simándi, Z., Hegedűs, É., Szabó, G., Tóth, K., Nagy, L., Vámosi, G.: Agonist binding directs dynamic competition among nuclear receptors for heterodimerization with retinoid X receptor.
    J. Biol. Chem. 295 (29), 10045-10061, 2020.
    Folyóirat-mutatók:
    D1 Biochemistry
    Q1 Cell Biology
    Q1 Molecular Biology
  2. Bojcsuk, D., Nagy, G., Bálint, B.: Alternatively Constructed Estrogen Receptor Alpha-Driven Super-Enhancers Result in Similar Gene Expression in Breast and Endometrial Cell Lines.
    Int. J. Mol. Sci. 21 1-18, 2020.
    Folyóirat-mutatók:
    Q2 Catalysis
    D1 Computer Science Applications
    D1 Inorganic Chemistry
    Q1 Medicine (miscellaneous)
    Q2 Molecular Biology
    D1 Organic Chemistry
    D1 Physical and Theoretical Chemistry
    D1 Spectroscopy
  3. Nagy, G., Nagy, L.: Motif grammar: the basis of the language of gene expression.
    Computational and Structural Biotechnology Journal. 18 2026-2032, 2020.
    Folyóirat-mutatók:
    Q1 Biochemistry
    D1 Biophysics
    D1 Biotechnology
    D1 Computer Science Applications
    Q1 Genetics
    Q2 Structural Biology
  4. Csumita, M., Csermely, A., Horváth, A., Nagy, G., Monori, F., Göczi, L., Orbea, H., Reith, W., Széles, L.: Specific enhancer selection by IRF3, IRF5 and IRF9 is determined by ISRE half-sites, 5' and 3' flanking bases, collaborating transcription factors and the chromatin environment in a combinatorial fashion.
    Nucleic Acids Res. 48 (2), 589-604, 2020.
    Folyóirat-mutatók:
    D1 Genetics
  5. Dániel, B., Czimmerer, Z., Halász, L., Botó, P., Kolostyák, Z., Póliska, S., Berger, W., Tzerpos, P., Nagy, G., Horváth, A., Hajas, G., Silye-Cseh, T., Nagy, A., Sauer, S., Francois-Deleuze, J., Szatmári, I., Bácsi, A., Nagy, L.: The transcription factor EGR2 is the molecular linchpin connecting STAT6 activation to the late, stable epigenomic program of alternative macrophage polarization.
    Genes Dev. 34 (21-22), 1474-1492, 2020.
    Folyóirat-mutatók:
    D1 Developmental Biology
    D1 Genetics
  6. Nagy, G., Dániel, B., Cuaranta-Monroy, I., Nagy, L.: Unraveling the Hierarchy of cis and trans Factors That Determine the DNA Binding by Peroxisome Proliferator-Activated Receptor γ.
    Mol. Cell. Biol. 40 (7), 1-20, 2020.
    Folyóirat-mutatók:
    Q1 Cell Biology
    Q1 Molecular Biology
2019
  1. Patsalos, A., Tzerpos, P., Halász, L., Nagy, G., Pap, A., Giannakis, N., Lyroni, K., Koliaraki, V., Pintye, É., Dezső, B., Kollias, G., Spilianakis, C., Nagy, L.: The BACH1-HMOX1 Regulatory Axis Is Indispensable for Proper Macrophage Subtype Specification and Skeletal Muscle Regeneration.
    J. Immunol. 203 (6), 1532-1547, 2019.
    Folyóirat-mutatók:
    Q1 Immunology
    Q1 Immunology and Allergy
2018
  1. Czimmerer, Z., Horváth, A., Dániel, B., Nagy, G., Cuaranta-Monroy, I., Kiss, M., Kolostyák, Z., Póliska, S., Steiner, L., Giannakis, N., Varga, T., Nagy, L.: Dynamic transcriptional control of macrophage miRNA signature via inflammation responsive enhancers revealed using a combination of next generation sequencing-based approaches.
    Biochim. Biophys. Acta. Gene Regul. Mech. 1861 (1), 14-28, 2018.
    Folyóirat-mutatók:
    D1 Biochemistry
    D1 Biophysics
    Q1 Genetics
    Q1 Molecular Biology
    Q1 Structural Biology
  2. Czimmerer, Z., Nagy, Z., Nagy, G., Horváth, A., Silye-Cseh, T., Kriston, Á., Jonás, D., Sauer, S., Steiner, L., Dániel, B., Deleuze, J., Nagy, L.: Extensive and functional overlap of the STAT6 and RXR cistromes in the active enhancer repertoire of human CD14+ monocyte derived differentiating macrophages.
    Mol. Cell. Endocrinol. 471 63-74, 2018.
    Folyóirat-mutatók:
    Q1 Biochemistry
    Q1 Endocrinology
    Q2 Molecular Biology
  3. Dániel, B., Nagy, G., Horváth, A., Czimmerer, Z., Cuaranta-Monroy, I., Póliska, S., Hays, T., Sauer, S., Francois-Deleuze, J., Nagy, L.: The IL-4/STAT6/PPAR[gamma] signaling axis is driving the expansion of the RXR heterodimer cistrome, providing complex ligand responsiveness in macrophages.
    Nucleic Acids Res. 46 (9), 4425-4439, 2018.
    Folyóirat-mutatók:
    D1 Genetics
  4. Dániel, B., Nagy, G., Czimmerer, Z., Horváth, A., Hammers, D., Cuaranta-Monroy, I., Póliska, S., Tzerpos, P., Kolostyák, Z., Hays, T., Patsalos, A., Houtman, R., Sauer, S., Francois-Deleuze, J., Rastinejad, F., Bálint, B., Sweeney, H., Nagy, L.: The Nuclear Receptor PPAR[gamma] Controls Progressive Macrophage Polarization as a Ligand-Insensitive Epigenomic Ratchet of Transcriptional Memory.
    Immunity. 49 (4), 615-626, 2018.
    Folyóirat-mutatók:
    D1 Immunology
    D1 Immunology and Allergy
    D1 Infectious Diseases
  5. Czimmerer, Z., Dániel, B., Horváth, A., Rückerl, D., Nagy, G., Kiss, M., Peloquin, M., Budai, M., Cuaranta-Monroy, I., Simándi, Z., Steiner, L., Nagy, B., Póliska, S., Bankó, C., Bacsó, Z., Schulman, I., Sauer, S., Deleuze, J., Allen, J., Benkő, S., Nagy, L.: The Transcription Factor STAT6 Mediates Direct Repression of Inflammatory Enhancers and Limits Activation of Alternatively Polarized Macrophages.
    Immunity. 48 (1), 75-90, 2018.
    Folyóirat-mutatók:
    D1 Immunology
    D1 Immunology and Allergy
    D1 Infectious Diseases
2017
  1. Kiss, M., Czimmerer, Z., Nagy, G., Bieniasz-Krzywiec, P., Ehling, M., Pap, A., Póliska, S., Botó, P., Tzerpos, P., Horváth, A., Kolostyák, Z., Dániel, B., Szatmári, I., Mazzone, M., Nagy, L.: Retinoid X receptor suppresses a metastasis-promoting transcriptional program in myeloid cells via a ligand-insensitive mechanism.
    Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 114 (40), 10725-10730, 2017.
    Folyóirat-mutatók:
    D1 Multidisciplinary
2016
  1. Varga, T., Mounier, R., Patsalos, A., Gogolák, P., Peloquin, M., Horváth, A., Pap, A., Dániel, B., Nagy, G., Pintye, É., Póliska, S., Cuvellier, S., Ben Larbi, S., Sansbury, B., Spite, M., Brown, C., Chazaud, B., Nagy, L.: Macrophage PPAR[gamma], a Lipid Activated Transcription Factor Controls the Growth Factor GDF3 and Skeletal Muscle Regeneration.
    Immunity. 45 (5), 1038-1051, 2016.
    Folyóirat-mutatók:
    D1 Immunology
    D1 Immunology and Allergy
    D1 Infectious Diseases
  2. Nagy, G., Czipa, E., Steiner, L., Nagy, T., Pongor, S., Nagy, L., Barta, E.: Motif oriented high-resolution analysis of ChIP-seq data reveals the topological order of CTCF and cohesin proteins on DNA.
    BMC Genomics. 17 (637), 1-9, 2016.
    Folyóirat-mutatók:
    D1 Biotechnology
    Q1 Genetics
  3. Czimmerer, Z., Varga, T., Kiss, M., Vázquez, C., Doan-Xuan, Q., Rückerl, D., Tattikota, S., Yan, X., Nagy, Z., Dániel, B., Póliska, S., Horváth, A., Nagy, G., Varallyay, É., Poy, M., Allen, J., Bacsó, Z., Abreu-Goodger, C., Nagy, L.: The IL-4/STAT6 signaling axis establishes a conserved microRNA signature in human and mouse macrophages regulating cell survival via miR-342-3p.
    Genome Med. 8 (1), 1-22, 2016.
    Folyóirat-mutatók:
    D1 Genetics
    D1 Genetics (clinical)
    D1 Molecular Biology
    D1 Molecular Medicine
2014
  1. Cuaranta-Monroy, I., Simándi, Z., Kolostyák, Z., Doan-Xuan, Q., Póliska, S., Horváth, A., Nagy, G., Bacsó, Z., Nagy, L.: Highly efficient differentiation of embryonic stem cells into adipocytes by ascorbic acid.
    Stem Cell Res. 13 (1), 88-97, 2014.
    Folyóirat-mutatók:
    Q2 Cell Biology
    Q2 Developmental Biology
    D1 Medicine (miscellaneous)
  2. Dániel, B., Nagy, G., Hah, N., Horváth, A., Czimmerer, Z., Póliska, S., Gyuris, T., Keirsse, J., Gysemans, C., Van Ginderachter, J., Bálint, B., Evans, R., Barta, E., Nagy, L.: The active enhancer network operated by liganded RXR supports angiogenic activity in macrophages.
    Genes Dev. 28 (14), 1562-1577, 2014.
    Folyóirat-mutatók:
    D1 Developmental Biology
    D1 Genetics
  3. Dániel, B., Nagy, G., Nagy, L.: The intriguing complexities of mammalian gene regulation: how to link enhancers to regulated genes. Are we there yet?.
    FEBS Lett. 588 (15), 2379-2391, 2014.
    Folyóirat-mutatók:
    Q1 Biochemistry
    D1 Biophysics
    Q2 Cell Biology
    Q1 Genetics
    Q2 Molecular Biology
    Q2 Structural Biology
2013
  1. Nagy, G., Dániel, B., Jonás, D., Nagy, L., Barta, E.: A novel method to predict regulatory regions based on histone mark landscapes in macrophages.
    Immunobiology. 218 (11), 1416-1427, 2013.
    Folyóirat-mutatók:
    Q1 Hematology
    Q2 Immunology
    Q1 Immunology and Allergy
Mindet mutasd
frissítve: 2024-10-12, 01:24

Tudományos folyóiratcikkek
SCImago besorolása

Tudományos folyóiratcikkek száma: 26
Q1/D1 20 (76.9%)
Q1 26 (100%)
-
OK

SCImago kategóriák

Biochemistry, Genetics and Molecular Biology (17)
Genetics (11)
Molecular Biology (8)
Biochemistry (5)
Cell Biology (4)
Biophysics (3)
Developmental Biology (3)
Structural Biology (3)
Biotechnology (2)
Endocrinology (2)
Molecular Medicine (1)
Medicine (12)
Immunology and Allergy (8)
Medicine (miscellaneous) (4)
Infectious Diseases (3)
Genetics (clinical) (1)
Hematology (1)
Immunology and Microbiology (8)
Immunology (8)
Computer Science (2)
Computer Science Applications (2)
Chemical Engineering (1)
Catalysis (1)
Chemistry (1)
Inorganic Chemistry (1)
Organic Chemistry (1)
Physical and Theoretical Chemistry (1)
Spectroscopy (1)
Multidisciplinary (1)
Multidisciplinary (1)

Közlemények megoszlása
műfaj szerint

Közlemények megoszlása
évszám szerint

Közlemények megoszlása
nyelv szerint

iDEa társszerzők

További társszerzők

Egyéb társszerzők

Cuaranta-Monroy, Ixchelt
Kolostyák Zsuzsanna
További társszerzők
Cuaranta-Monroy, Ixchelt
Kolostyák Zsuzsanna
Francois-Deleuze, Jean
Berger, Wilhelm K.
Deleuze, Jean-Francois
Giannakis, Nikolas
Abreu-Goodger, Cei
Ben Larbi, Sabrina
Bieniasz-Krzywiec, Pawel
Chazaud, Bénédicte
Cuvellier, Sylvain
Fischer, Cornelius
Koliaraki, Vasiliki
Lyroni, Konstantina
Mazzone, Massimiliano
Medina-Serpas, Miguel A.
Mianesaz, Hamidreza
Rastinejad, Fraydoon
Sansbury, Brian E.
Santegoets, Saskia J. A. M.
Schoggins, John W.
Spilianakis, Charalampos G.
Szebeni Gábor János
Tattikota, Sudhir Gopal
Thelemann, Christoph
Van Ginderachter, Jo A.
Vázquez, Cesaré Ovando